More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5168 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  97.88 
 
 
283 aa  564  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  98.23 
 
 
283 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  90.46 
 
 
283 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  86.12 
 
 
281 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  85.77 
 
 
281 aa  500  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  84.59 
 
 
280 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  80.78 
 
 
281 aa  470  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  83.87 
 
 
280 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  83.87 
 
 
280 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  84.23 
 
 
280 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  83.87 
 
 
280 aa  464  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  77.42 
 
 
279 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  76.07 
 
 
281 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  75.71 
 
 
279 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  75.71 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  75.71 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  77.78 
 
 
281 aa  438  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  77.3 
 
 
289 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  75.63 
 
 
288 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  75 
 
 
290 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  72.4 
 
 
301 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  73.65 
 
 
283 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  73.38 
 
 
278 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  74.18 
 
 
281 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  71.89 
 
 
281 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  72.24 
 
 
281 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  74.01 
 
 
280 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  73.21 
 
 
297 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  73.29 
 
 
295 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  72.95 
 
 
281 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  71.53 
 
 
281 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  75 
 
 
281 aa  421  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  72.66 
 
 
279 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  71.22 
 
 
280 aa  421  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  71.22 
 
 
278 aa  421  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  73.55 
 
 
293 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  75.36 
 
 
294 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  71.17 
 
 
281 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  76.43 
 
 
281 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  74.01 
 
 
285 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  71.53 
 
 
281 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  72.92 
 
 
292 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  71.17 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  71.17 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  70.86 
 
 
280 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  71.17 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  71.17 
 
 
281 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  71.17 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.99 
 
 
282 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  71.48 
 
 
280 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  71.01 
 
 
289 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  71.28 
 
 
282 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  71.28 
 
 
284 aa  411  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  71.63 
 
 
284 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  70.5 
 
 
280 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  70.82 
 
 
284 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  75.09 
 
 
280 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  75.09 
 
 
280 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  75.09 
 
 
280 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  68.71 
 
 
290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  75.09 
 
 
317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  75.09 
 
 
317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  74.73 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  74.37 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  74.73 
 
 
280 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  69.5 
 
 
284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  72.92 
 
 
280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  73.65 
 
 
280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  67.74 
 
 
284 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  69.15 
 
 
284 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  72.56 
 
 
280 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  68.71 
 
 
284 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  68.84 
 
 
277 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  67.38 
 
 
284 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  71.84 
 
 
286 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  72.2 
 
 
280 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  71.48 
 
 
280 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  71.84 
 
 
286 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  71.84 
 
 
286 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  71.48 
 
 
280 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  71.12 
 
 
280 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  68.68 
 
 
286 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  68.79 
 
 
284 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  56.18 
 
 
291 aa  308  9e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  57.09 
 
 
289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  56.41 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  57.52 
 
 
278 aa  302  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  47.76 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  47.64 
 
 
280 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  45.32 
 
 
281 aa  244  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  46.8 
 
 
311 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  46.54 
 
 
331 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  42.21 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0936  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  76.8 
 
 
154 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  43.48 
 
 
308 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.71 
 
 
315 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.72 
 
 
318 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1601  AAA ATPase  39.65 
 
 
335 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0586  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.33 
 
 
324 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>