23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4996 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  52.73 
 
 
70 aa  68.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  44.64 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  57.45 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  55.1 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  54.9 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  54.9 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  46.15 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  47.27 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  49.02 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  42.31 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  48.94 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  41.27 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1463  hypothetical protein  47.17 
 
 
74 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3626  hypothetical protein  35.94 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  44.9 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0108  hypothetical protein  41.3 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0256  hypothetical protein  34.92 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0573  hypothetical protein  33.87 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0450  hypothetical protein  30.16 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000414682  normal  0.357925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>