91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4970 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  91.36 
 
 		 349 aa  547  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  91.36 
 
 		 301 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  72.4 
 
 		 313 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  68.01 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  68.4 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  43.7 
 
 		 276 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  41.48 
 
 		 276 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  40.58 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  38.85 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  39.31 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  37.01 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  36.56 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  35.56 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  37.09 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  35.34 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  34.77 
 
 		 308 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  34.53 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  37.41 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  30.42 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  32.01 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  34.74 
 
 		 603 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  31.91 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  30.17 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  37.2 
 
 		 607 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.73 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  30.98 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  25.77 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  30.59 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  27.14 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  31.1 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  31.21 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  28.41 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  29.43 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  30.63 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.87 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  31.01 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  23.29 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  27.64 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  29.08 
 
 		 247 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.44 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  24.21 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.3 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  27.06 
 
 		 248 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  22 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  26.47 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  25.29 
 
 		 393 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  26.53 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  23.51 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2496  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00269298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  25.42 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0439  ribonuclease Z  24.18 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  25.42 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  25.42 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  25.42 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  25.42 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0886  hypothetical protein  25.35 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28.06 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  25.25 
 
 		 235 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1193  ribonuclease Z  23.33 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  19.44 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  26.19 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0659  ribonuclease Z  21.13 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  29.81 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.59 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  24.37 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1776  ribonuclease Z  30.38 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.4 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  30.54 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  28.45 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  28.89 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  25.11 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  26.51 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2582  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  23.79 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  24.51 
 
 		 264 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2145  RNAse Z  28.57 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.131519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>