81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4953 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  92.65 
 
 		 1047 aa  1857    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  92.93 
 
 		 1047 aa  1864    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1045 aa  2028    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  64.78 
 
 		 1037 aa  1193    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  63.43 
 
 		 1040 aa  1142    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  42.87 
 
 		 1049 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  66.44 
 
 		 1054 aa  1241    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  44.94 
 
 		 1043 aa  674    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  42.23 
 
 		 1049 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  45.27 
 
 		 1015 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  39.93 
 
 		 1076 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  42.21 
 
 		 1049 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  42.71 
 
 		 1048 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  42.4 
 
 		 1053 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  41.83 
 
 		 1042 aa  598  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  41.33 
 
 		 1048 aa  598  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  40 
 
 		 1052 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1042 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  40 
 
 		 1052 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  40.13 
 
 		 1052 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  37.05 
 
 		 1047 aa  555  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  38.95 
 
 		 1001 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  37.33 
 
 		 1059 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  36.82 
 
 		 1064 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  36.6 
 
 		 1062 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  37.8 
 
 		 1064 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1018 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  35.98 
 
 		 999 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1016 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  36.24 
 
 		 991 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  32.93 
 
 		 977 aa  362  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  34.79 
 
 		 1014 aa  359  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  33.59 
 
 		 986 aa  350  6e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.86 
 
 		 988 aa  344  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  34.18 
 
 		 991 aa  320  9e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  32.41 
 
 		 993 aa  319  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  32.7 
 
 		 980 aa  302  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  32.92 
 
 		 959 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  39.87 
 
 		 1000 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  40.4 
 
 		 997 aa  238  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  40.04 
 
 		 997 aa  235  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.83 
 
 		 890 aa  147  8.000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  19.01 
 
 		 911 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  18.96 
 
 		 914 aa  121  7e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.91 
 
 		 947 aa  94.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.45 
 
 		 958 aa  93.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  25.69 
 
 		 962 aa  91.3  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  24.93 
 
 		 788 aa  88.2  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  24.93 
 
 		 788 aa  85.9  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  24.08 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.82 
 
 		 836 aa  84  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  24.82 
 
 		 951 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.7 
 
 		 779 aa  75.9  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.62 
 
 		 976 aa  69.7  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.63 
 
 		 957 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  43.3 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.1 
 
 		 951 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.54 
 
 		 908 aa  61.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.85 
 
 		 1066 aa  59.3  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  24.69 
 
 		 997 aa  55.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21.66 
 
 		 781 aa  55.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  28.99 
 
 		 846 aa  54.7  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.95 
 
 		 1048 aa  52.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  20.5 
 
 		 994 aa  52.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  25.36 
 
 		 856 aa  51.6  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  28.49 
 
 		 864 aa  51.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1100 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.78 
 
 		 1049 aa  50.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.61 
 
 		 915 aa  50.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  24.77 
 
 		 930 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  26.8 
 
 		 855 aa  49.3  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 1096 aa  48.9  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.8 
 
 		 1106 aa  48.5  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  21.29 
 
 		 858 aa  48.5  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  37.76 
 
 		 1135 aa  48.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.57 
 
 		 906 aa  47.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  37.08 
 
 		 1060 aa  46.6  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  29.75 
 
 		 896 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  29.59 
 
 		 1055 aa  45.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 		 1059 aa  45.1  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.01 
 
 		 984 aa  44.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>