More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4891 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
1867 aa  3835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
1301 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
1303 aa  566  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  33.31 
 
 
1239 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
1265 aa  523  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
1271 aa  516  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
1220 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  47.36 
 
 
1292 aa  357  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1786  glycosyl transferase, putative  26.51 
 
 
1147 aa  269  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0290  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
404 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0774  glycosyl transferase, group 1  39.52 
 
 
404 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  30.68 
 
 
1608 aa  182  8e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
924 aa  179  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
441 aa  91.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
447 aa  87.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3902  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  24.28 
 
 
664 aa  86.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
539 aa  84.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
401 aa  81.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.74 
 
 
412 aa  77  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.18 
 
 
403 aa  75.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
403 aa  75.5  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
466 aa  73.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
1067 aa  72.8  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
733 aa  70.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  21.89 
 
 
778 aa  67.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  33.57 
 
 
371 aa  67.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  67.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
377 aa  67  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4177  HAD superfamily hydrolase-like protein  24.23 
 
 
719 aa  66.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
440 aa  66.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1592  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
1147 aa  66.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
413 aa  65.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  24.3 
 
 
413 aa  65.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  23.17 
 
 
425 aa  65.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
425 aa  65.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
400 aa  64.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5889  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
863 aa  64.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0387615  normal  0.138972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
394 aa  63.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4551  hydrolase  26.67 
 
 
254 aa  63.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282317  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
426 aa  62.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  20.56 
 
 
377 aa  62.4  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  20.56 
 
 
377 aa  62.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.61 
 
 
775 aa  62  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4433  hydrolase  26.99 
 
 
791 aa  62  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.29 
 
 
397 aa  61.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0725  HAD superfamily hydrolase-like  27.83 
 
 
862 aa  61.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237174  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0193  HAD superfamily hydrolase-like protein  25.59 
 
 
608 aa  61.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2510  hypothetical protein  26.79 
 
 
470 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2954  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
376 aa  60.1  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 
408 aa  59.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 
445 aa  59.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
413 aa  59.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
414 aa  58.9  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
418 aa  58.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
385 aa  58.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 
588 aa  58.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211302  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  21.36 
 
 
377 aa  58.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
369 aa  58.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.37 
 
 
388 aa  58.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  24.86 
 
 
381 aa  58.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
377 aa  57.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  21.07 
 
 
395 aa  57.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
372 aa  57.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
414 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3945  hypothetical protein  42.71 
 
 
547 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.46 
 
 
362 aa  57  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
373 aa  56.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.43 
 
 
384 aa  56.6  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  38.82 
 
 
438 aa  56.2  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  24.91 
 
 
384 aa  56.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  23.05 
 
 
401 aa  55.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  25 
 
 
403 aa  55.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0883  putative glycosyl transferase  20.8 
 
 
649 aa  55.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.358667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
400 aa  55.8  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
406 aa  55.5  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.64 
 
 
385 aa  55.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0850  putative glycosyl transferase  23.68 
 
 
649 aa  55.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  24.54 
 
 
234 aa  55.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
378 aa  55.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
404 aa  55.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  39.47 
 
 
370 aa  55.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0786  putative glycosyl transferase  21.03 
 
 
649 aa  55.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0373928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
689 aa  55.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
408 aa  55.5  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  22.12 
 
 
385 aa  55.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  24.48 
 
 
392 aa  54.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
401 aa  55.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 
498 aa  54.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 
443 aa  54.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 
355 aa  54.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 
443 aa  54.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
443 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  24.65 
 
 
382 aa  54.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
407 aa  54.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  21.83 
 
 
452 aa  54.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 
495 aa  54.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
381 aa  54.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0239  glycosyl transferase group 1  48.21 
 
 
595 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 
499 aa  54.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>