69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4889 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  910    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  80 
 
 		 465 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  41.2 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  48.94 
 
 		 418 aa  259  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  40.26 
 
 		 499 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  38.75 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  46.21 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  44.37 
 
 		 346 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  38.41 
 
 		 1050 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  40.61 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  39.39 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  39 
 
 		 594 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  43.16 
 
 		 343 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  50.58 
 
 		 452 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  37.05 
 
 		 738 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  54.61 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  46 
 
 		 308 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  54.17 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  46.02 
 
 		 283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  44.5 
 
 		 465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  51.22 
 
 		 641 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  44.07 
 
 		 743 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  30.51 
 
 		 644 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  46.07 
 
 		 848 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  35.18 
 
 		 1503 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  41.67 
 
 		 273 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 792 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  35.32 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40.8 
 
 		 561 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  37.71 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  37.71 
 
 		 266 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  43.36 
 
 		 207 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  43.36 
 
 		 207 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.18 
 
 		 589 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  39.86 
 
 		 833 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  36 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  38.27 
 
 		 232 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  30.86 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  39.86 
 
 		 220 aa  96.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  38.81 
 
 		 292 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  35.36 
 
 		 1462 aa  93.2  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  33.66 
 
 		 340 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35 
 
 		 950 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  28.74 
 
 		 319 aa  88.2  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  38.19 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  38.12 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  31.03 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  36.75 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  34.25 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  35 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  27.38 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  33.03 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  35.37 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  37.32 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  31.77 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  59.02 
 
 		 190 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  28.42 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  31.38 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  30.5 
 
 		 1043 aa  71.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  30.46 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2477  hypothetical protein  36.67 
 
 		 190 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 		 854 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  42.05 
 
 		 197 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2421  hypothetical protein  38.55 
 
 		 85 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1097  hypothetical protein  32.17 
 
 		 208 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.68714  decreased coverage  0.00547678 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  29.63 
 
 		 348 aa  44.3  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  29.73 
 
 		 230 aa  43.9  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>