241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4832 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  87.55 
 
 
255 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  89.3 
 
 
243 aa  441  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  67.27 
 
 
241 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  68.18 
 
 
243 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  52.61 
 
 
257 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  54.35 
 
 
244 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  50.22 
 
 
259 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  52 
 
 
254 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  55.67 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0095  protein of unknown function DUF159  49.12 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  49.33 
 
 
259 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  47.26 
 
 
254 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  48.44 
 
 
257 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0711  hypothetical protein  47.26 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.590948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  45.57 
 
 
254 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2613  hypothetical protein  43.28 
 
 
262 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  46.67 
 
 
222 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  42.23 
 
 
251 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2022  hypothetical protein  42.13 
 
 
252 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00187393  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  44.05 
 
 
238 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  42.08 
 
 
259 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  42.54 
 
 
233 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  40.89 
 
 
222 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  41.85 
 
 
224 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  44 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  41.15 
 
 
235 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  45.13 
 
 
226 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  43.36 
 
 
221 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  45.96 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  40.69 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  46.75 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  41.96 
 
 
224 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  41.28 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  39.3 
 
 
222 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  43.28 
 
 
243 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  38.39 
 
 
232 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  43.51 
 
 
250 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  39.66 
 
 
233 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  39.27 
 
 
219 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  37.99 
 
 
224 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  41.13 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  44.25 
 
 
222 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  43.61 
 
 
221 aa  145  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  36.09 
 
 
227 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  34.31 
 
 
234 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  38.17 
 
 
233 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  39.09 
 
 
253 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  39.84 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  42.49 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1864  hypothetical protein  33.92 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00030061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  36.95 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  41.23 
 
 
253 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  41.07 
 
 
236 aa  138  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  37.7 
 
 
268 aa  138  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  39.69 
 
 
262 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2383  hypothetical protein  46.59 
 
 
204 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.518006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  36.77 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  37.4 
 
 
290 aa  135  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  37.84 
 
 
261 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  39.51 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  38.16 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  37.3 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  37.61 
 
 
226 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  38.82 
 
 
253 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  36.74 
 
 
266 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  36.74 
 
 
266 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  41.67 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  39.06 
 
 
254 aa  132  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  36.52 
 
 
231 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  39.24 
 
 
239 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  36.88 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  42.39 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  38.37 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  39.83 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  34.2 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  36.73 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  36.96 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  33.76 
 
 
240 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  36.8 
 
 
248 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  36.03 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  35.18 
 
 
253 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  35.45 
 
 
231 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  39.44 
 
 
248 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  37.61 
 
 
242 aa  121  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  39.06 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  35.65 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  33.05 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  37.39 
 
 
239 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  34.21 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08091  hypothetical protein  33.5 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  35.62 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  33.77 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3704  protein of unknown function DUF159  33.46 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  36.97 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  33.62 
 
 
222 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  30.97 
 
 
222 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  36 
 
 
213 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>