More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4801 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4801  ATP-dependent helicase HrpB  100 
 
 		 826 aa  1562    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.510158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3275  ATP-dependent helicase HrpB  56.48 
 
 		 821 aa  834    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3449  ATP-dependent helicase HrpB  55.76 
 
 		 814 aa  723    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.206852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1838  ATP-dependent helicase HrpB  48.64 
 
 		 846 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0458406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4772  ATP-dependent helicase HrpB  49.65 
 
 		 842 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0178797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0147  ATP-dependent helicase HrpB  58.01 
 
 		 818 aa  862    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0067  DEAD box-like helicase  57.02 
 
 		 820 aa  834    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0419076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4735  ATP-dependent helicase HrpB  46.5 
 
 		 840 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.784057  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0127  ATP-dependent helicase HrpB  59.83 
 
 		 832 aa  878    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00299316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0536  ATP-dependent helicase HrpB  63.9 
 
 		 825 aa  941    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09990  DEAH-box ATP-dependent helicase HrpB  51.9 
 
 		 838 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4320  ATP-dependent helicase HrpB  49.47 
 
 		 844 aa  672    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.043486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0648  ATP-dependent helicase HrpB  50.12 
 
 		 842 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242487  normal  0.649022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0359  ATP-dependent helicase HrpB  62.74 
 
 		 872 aa  971    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3081  ATP-dependent helicase HrpB  48.48 
 
 		 827 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.895104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1261  ATP-dependent helicase HrpB  59.08 
 
 		 825 aa  908    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0343419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6547  ATP-dependent helicase HrpB  74.21 
 
 		 823 aa  989    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.10181  normal  0.639209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4935  ATP-dependent helicase HrpB  49.29 
 
 		 839 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1180  ATP-dependent helicase HrpB  47.4 
 
 		 828 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9477e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2365  ATP-dependent helicase HrpB  52.02 
 
 		 860 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.701913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4648  ATP-dependent helicase HrpB  49.76 
 
 		 842 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.052727  normal  0.20008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0505  ATP-dependent helicase HrpB  60.86 
 
 		 870 aa  946    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.967773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0595  ATP-dependent helicase HrpB  77.72 
 
 		 821 aa  1063    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.420753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4854  ATP-dependent helicase HrpB  61.37 
 
 		 877 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.951101 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0192  ATP-dependent helicase HrpB  52.25 
 
 		 917 aa  686    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0135151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0302  ATP-dependent helicase HrpB  64.4 
 
 		 825 aa  971    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0559  ATP-dependent helicase HrpB  48.05 
 
 		 822 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0455  ATP-dependent helicase HrpB  63.75 
 
 		 829 aa  961    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0516  ATP-dependent helicase HrpB  48.42 
 
 		 822 aa  643    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.355693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4319  ATP-dependent helicase HrpB  56.9 
 
 		 821 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4043  ATP-dependent helicase HrpB  58.54 
 
 		 821 aa  814    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  47.03 
 
 		 842 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1590  ATP-dependent helicase HrpB  58.54 
 
 		 825 aa  822    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7107  ATP-dependent helicase HrpB  74.03 
 
 		 850 aa  1060    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4284  ATP-dependent helicase HrpB  91.36 
 
 		 854 aa  1343    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3739  ATP-dependent helicase HrpB  49.94 
 
 		 844 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  63.66 
 
 		 824 aa  956    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4651  ATP-dependent helicase HrpB  91.24 
 
 		 833 aa  1390    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262977  normal  0.748056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4808  ATP-dependent helicase HrpB  48.29 
 
 		 844 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2129  ATP-dependent helicase HrpB  62.99 
 
 		 837 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0073  ATP-dependent helicase HrpB  48.3 
 
 		 824 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1148  ATP-dependent helicase HrpB  50.36 
 
 		 838 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658712  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1588  ATP-dependent helicase HrpB  50.72 
 
 		 847 aa  659    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.41464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3991  ATP-dependent helicase HrpB  57.87 
 
 		 821 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1349  ATP-dependent helicase HrpB  48.22 
 
 		 842 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.228837  hitchhiker  0.00000000348515 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1306  ATP-dependent helicase HrpB  45.63 
 
 		 900 aa  630  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.493804  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2580  ATP-dependent RNA helicase  50.66 
 
 		 834 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.262395  hitchhiker  0.0000513711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1083  ATP-dependent helicase HrpB  48.81 
 
 		 829 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0976  ATP-dependent helicase HrpB  48.46 
 
 		 848 aa  619  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0156609  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2844  ATP-dependent helicase HrpB  47.3 
 
 		 830 aa  614  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.454612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3982  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.58 
 
 		 812 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0579093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0669  ATP-dependent helicase HrpB  47.78 
 
 		 841 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.51 
 
 		 809 aa  611  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2470  ATP-dependent helicase HrpB  45.64 
 
 		 844 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.590615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3111  ATP-dependent helicase HrpB  50.18 
 
 		 808 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.577878  normal  0.0241826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2348  ATP-dependent helicase HrpB  45.26 
 
 		 842 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0157  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.78 
 
 		 824 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2013  DEAD/DEAH box helicase  49.7 
 
 		 808 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0723  ATP-dependent helicase HrpB  49.94 
 
 		 808 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336305  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0221  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.51 
 
 		 824 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00147  predicted ATP-dependent helicase  44.42 
 
 		 809 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0534884  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3454  ATP-dependent helicase HrpB  44.66 
 
 		 824 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.629145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00146  hypothetical protein  44.42 
 
 		 809 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0519083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0205  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.76 
 
 		 824 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.879127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1172  ATP-dependent helicase HrpB  46.65 
 
 		 863 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1355  ATP-dependent helicase HrpB  50.49 
 
 		 817 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.166416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0217  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.76 
 
 		 824 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.976044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0098  ATP-dependent helicase HrpB  47.54 
 
 		 826 aa  595  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.310548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0206  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.39 
 
 		 824 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.776045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3511  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.54 
 
 		 824 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.661022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0665  ATP-dependent helicase protein, putative  48.01 
 
 		 832 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0159  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.3 
 
 		 824 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.805468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03444  ATP-dependent RNA helicase HrpB  40.39 
 
 		 833 aa  595  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0223  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.52 
 
 		 824 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2061  ATP-dependent helicase HrpB  46.59 
 
 		 837 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0816695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0139  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.3 
 
 		 809 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3886  ATP-dependent helicase HrpB  46.54 
 
 		 834 aa  590  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0151  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.3 
 
 		 809 aa  592  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000698462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3110  ATP-dependent helicase  41.03 
 
 		 826 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.924657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1001  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.24 
 
 		 853 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0152  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.05 
 
 		 809 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3464  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.24 
 
 		 829 aa  588  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3335  ATP-dependent RNA helicase HrpB  45.11 
 
 		 834 aa  586  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.825067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3111  ATP-dependent RNA helicase HrpB  43.33 
 
 		 820 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0501  ATP-dependent helicase HrpB  43.33 
 
 		 833 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12630  putative ATP-dependent helicase  48.19 
 
 		 830 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1167  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.01 
 
 		 814 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1773  ATP-dependent helicase HrpB  46.19 
 
 		 798 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0295014  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0554  ATP-dependent helicase HrpB  39.81 
 
 		 848 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2816  ATP-dependent RNA helicase HrpB  44.76 
 
 		 812 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2603  ATP-dependent RNA helicase HrpB  38.58 
 
 		 821 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3458  ATP-dependent helicase HrpB  47.04 
 
 		 798 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0565  ATP-dependent helicase  42.93 
 
 		 833 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0640  ATP-dependent helicase HrpB  48.93 
 
 		 802 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163213  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03270  ATP-dependent RNA helicase  46.12 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1573  thiolase  42.19 
 
 		 864 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002567  ATP-dependent helicase HrpB  40.22 
 
 		 822 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1035  ATP-dependent RNA helicase HrpB  43.51 
 
 		 825 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3869  ATP-dependent helicase HrpB  39.43 
 
 		 849 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0632  ATP-dependent helicase HrpB  39.88 
 
 		 835 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>