42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4783 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 342 aa  682    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  94.43 
 
 		 342 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  93.27 
 
 		 343 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  66.03 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  63 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  55.05 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  53.8 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  51.9 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  50.52 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  48.66 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  47.75 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  48.32 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  50.51 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  40.67 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.45 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  25.41 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  26.19 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1269  hypothetical protein  26.57 
 
 		 285 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.66 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4562  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.27 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>