More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4721 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.1 
 
 		 1032 aa  996    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.62 
 
 		 1007 aa  1018    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.32 
 
 		 989 aa  1067    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  84.14 
 
 		 995 aa  1675    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.91 
 
 		 1025 aa  1007    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.07 
 
 		 1025 aa  948    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  76.81 
 
 		 974 aa  1460    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.97 
 
 		 1038 aa  987    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 990 aa  2018    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.33 
 
 		 961 aa  992    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  51.86 
 
 		 1046 aa  961    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  54.21 
 
 		 973 aa  986    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  56.22 
 
 		 1007 aa  1031    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  94.63 
 
 		 990 aa  1890    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.85 
 
 		 983 aa  1500    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.8 
 
 		 1005 aa  999    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  41.12 
 
 		 973 aa  653    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.46 
 
 		 978 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  55.13 
 
 		 984 aa  1016    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  94.93 
 
 		 990 aa  1897    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.78 
 
 		 976 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.29 
 
 		 962 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.4 
 
 		 968 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  39.82 
 
 		 952 aa  582  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  37.37 
 
 		 996 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.43 
 
 		 1014 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.37 
 
 		 977 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.41 
 
 		 1034 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.84 
 
 		 991 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  34.34 
 
 		 967 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.49 
 
 		 971 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.42 
 
 		 1015 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  37.69 
 
 		 967 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.74 
 
 		 1031 aa  555  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.62 
 
 		 1011 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  34.35 
 
 		 975 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 		 1032 aa  547  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.15 
 
 		 999 aa  549  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.35 
 
 		 1009 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.04 
 
 		 976 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  36.09 
 
 		 1024 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.07 
 
 		 983 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  35.51 
 
 		 999 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.77 
 
 		 1037 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  35.03 
 
 		 1013 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.5 
 
 		 1023 aa  524  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.9 
 
 		 1022 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  35.56 
 
 		 1015 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.89 
 
 		 1035 aa  525  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  35.15 
 
 		 1024 aa  520  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  35.14 
 
 		 1055 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  35.52 
 
 		 987 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  37.71 
 
 		 1050 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  35.18 
 
 		 1043 aa  512  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  37.89 
 
 		 1050 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  34.12 
 
 		 1070 aa  511  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.2 
 
 		 966 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.92 
 
 		 1023 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  37.6 
 
 		 976 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  37.6 
 
 		 1052 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  33.03 
 
 		 976 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.54 
 
 		 945 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  33.54 
 
 		 984 aa  489  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  32.26 
 
 		 930 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.04 
 
 		 1000 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2844  putative oxidoreductase  36.71 
 
 		 949 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.788098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.95 
 
 		 948 aa  482  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 		 950 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.61 
 
 		 989 aa  458  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1756  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 1028 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.411598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2179  FAD linked oxidase domain protein  36.88 
 
 		 894 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 975 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.96 
 
 		 973 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.09 
 
 		 974 aa  436  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.12 
 
 		 1006 aa  429  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  33.86 
 
 		 997 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  32.67 
 
 		 1010 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0725  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.78 
 
 		 906 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0686  FAD linked oxidase domain protein  33.47 
 
 		 985 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17651  normal  0.98502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5581  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.64 
 
 		 1050 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.08 
 
 		 997 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4075  FAD linked oxidase domain protein  34.6 
 
 		 993 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.76 
 
 		 944 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.28 
 
 		 1002 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.04 
 
 		 1006 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.53 
 
 		 995 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.05 
 
 		 947 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.59 
 
 		 1023 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2060  FAD linked oxidase  32.84 
 
 		 978 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.717631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0150  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.67 
 
 		 977 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5319  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 		 1012 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  30.19 
 
 		 1018 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  30.09 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.21 
 
 		 1027 aa  390  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  30.19 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  29.99 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  29.99 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  29.99 
 
 		 1018 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.09 
 
 		 1023 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  29.89 
 
 		 1018 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>