126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4648 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  100 
 
 		 237 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  46.77 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  46.39 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  39.09 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  46.07 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  40.31 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  45.27 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  44.33 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  37.79 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  46.35 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  46.35 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  38.57 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  44 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  43.46 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  44.5 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  44.33 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  44.33 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  42.49 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  42.65 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  44.04 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  37.73 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  45.08 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  44.04 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  38.78 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  44.04 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  41.88 
 
 		 204 aa  141  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  39.18 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  40.1 
 
 		 202 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  42.93 
 
 		 202 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  40.59 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  38.14 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  40 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  36.18 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  40.31 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  41.62 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  38.86 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  37.63 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  41.97 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  41.97 
 
 		 211 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  42.19 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  37.82 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  37.25 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  42.27 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  37.63 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  37.11 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  38.34 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  40.21 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  41.45 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  38.46 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  35.96 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  35.12 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  44.2 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  39.81 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  38.54 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  31.43 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  29.53 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  46.46 
 
 		 109 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  35.6 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  32.67 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  26.01 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  31.58 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  30.95 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  27.91 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  25.48 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2849  protein of unknown function DUF161  32.09 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1586  hypothetical protein  25.61 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3759  hypothetical protein  25.61 
 
 		 293 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1413  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  26.21 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1124  hypothetical protein  24 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000105294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  24.16 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1697  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.264379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1440  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00353544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1412  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000497334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1553  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1624  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.459527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2126  protein of unknown function DUF161  26.09 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00308608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1658  hypothetical protein  26.25 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2106  hypothetical protein  28.33 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.874955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2358  Protein of unknown function DUF2179  29.1 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.127007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0493  Protein of unknown function DUF2179  26.92 
 
 		 290 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2061  protein of unknown function DUF161  26.63 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.512789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  23.59 
 
 		 322 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  23.45 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1456  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0996755  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2225  hypothetical protein  30.65 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.22076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1254  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1245  hypothetical protein  28.5 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  28.68 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1282  hypothetical protein  27.98 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1067  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1062  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1072  hypothetical protein  28.5 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  27.98 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1085  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1171  hypothetical protein  27.98 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  26.52 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0536  hypothetical protein  28.33 
 
 		 288 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  27.16 
 
 		 311 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>