71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4622 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  92.36 
 
 
176 aa  301  3e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  91.72 
 
 
176 aa  299  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  69.44 
 
 
184 aa  249  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  62.07 
 
 
177 aa  216  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1917  MxaD protein, putative  51.57 
 
 
176 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  53.25 
 
 
176 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  46.11 
 
 
174 aa  161  4e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3003  MxaD protein, putative  44.57 
 
 
177 aa  157  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0105582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2034  MxaD protein, putative  45.88 
 
 
167 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  48.08 
 
 
183 aa  146  2e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1790  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  47.17 
 
 
176 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.859721  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5019  putative signal peptide  46.95 
 
 
179 aa  145  4e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  42.53 
 
 
175 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  44.81 
 
 
179 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1839  putative signal peptide  46.58 
 
 
176 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2174  putative signal peptide  45.96 
 
 
176 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  43.02 
 
 
187 aa  135  3e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  45.06 
 
 
178 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  46.15 
 
 
173 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2727  putative signal peptide  42.68 
 
 
177 aa  124  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  40.35 
 
 
181 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  44.3 
 
 
178 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1840  hypothetical protein  38.86 
 
 
177 aa  116  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1819  MxaD protein, putative  42.44 
 
 
195 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2175  hypothetical protein  36.78 
 
 
177 aa  114  9e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.286876  normal  0.507077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  41.98 
 
 
176 aa  114  1e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0851  hypothetical protein  40.26 
 
 
185 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1791  putative exported protein of unknown function  35.95 
 
 
178 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.813923  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0024  hypothetical protein  38.71 
 
 
183 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  38.55 
 
 
157 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  36.17 
 
 
161 aa  87.4  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  41.28 
 
 
158 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  37.14 
 
 
157 aa  83.6  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  79.7  2e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  42.57 
 
 
157 aa  78.6  4e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  31.95 
 
 
168 aa  78.6  5e-14  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  33.54 
 
 
164 aa  74.7  6e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  33.8 
 
 
136 aa  68.2  5e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  30.36 
 
 
181 aa  66.6  2e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  30.68 
 
 
162 aa  62.8  3e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  31.75 
 
 
168 aa  61.2  7e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  29.93 
 
 
135 aa  61.2  8e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  30.34 
 
 
138 aa  58.5  4e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  58.9  4e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  57.4  1e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  29.25 
 
 
138 aa  57  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  29.25 
 
 
138 aa  57  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  29.25 
 
 
138 aa  57  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  29.25 
 
 
138 aa  57  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  29.66 
 
 
138 aa  56.2  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  30.07 
 
 
138 aa  55.8  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  32.17 
 
 
147 aa  55.5  4e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  31.37 
 
 
145 aa  55.1  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  54.3  9e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  29.37 
 
 
138 aa  54.3  9e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7414  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  52  4e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  30.7 
 
 
144 aa  52  4e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0713  hypothetical protein  24.83 
 
 
153 aa  49.7  2e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  49.7  2e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5458  hypothetical protein  26.36 
 
 
158 aa  48.9  4e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  34.58 
 
 
138 aa  48.1  6e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  34.58 
 
 
138 aa  48.1  6e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  27.15 
 
 
141 aa  48.1  7e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5012  hypothetical protein  28.04 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0536098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1985  hypothetical protein  28.18 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  31.03 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  29.08 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  30.28 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  26.21 
 
 
149 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>