More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4557 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4557  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 316 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.343587  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4443  ornithine carbamoyltransferase  94.94 
 
 		 316 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4076  ornithine carbamoyltransferase  94.94 
 
 		 330 aa  617  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7456  ornithine carbamoyltransferase  81.7 
 
 		 314 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6535  ornithine carbamoyltransferase  77.88 
 
 		 314 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  normal  0.847113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2317  ornithine carbamoyltransferase  83.17 
 
 		 326 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0831  ornithine carbamoyltransferase  72.88 
 
 		 317 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0151  ornithine carbamoyltransferase  72.85 
 
 		 319 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.950528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  70.1 
 
 		 308 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  68.42 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1219  ornithine carbamoyltransferase  67.95 
 
 		 309 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0784  ornithine carbamoyltransferase  68.42 
 
 		 328 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.107467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  68.75 
 
 		 308 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0896  ornithine carbamoyltransferase  66.78 
 
 		 316 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4915  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0760  ornithine carbamoyltransferase  66.12 
 
 		 308 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0403  ornithine carbamoyltransferase  65.57 
 
 		 313 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 		 312 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0315  ornithine carbamoyltransferase  63.12 
 
 		 312 aa  391  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0302  ornithine carbamoyltransferase  63.12 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0625047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0186  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.347949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0176  ornithine carbamoyltransferase  62.79 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0128  ornithine carbamoyltransferase  61.79 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0479  ornithine carbamoyltransferase  61.13 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0008  ornithine carbamoyltransferase  61.92 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2540  ornithine carbamoyltransferase  61.84 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0666  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.829817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1291  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  60.67 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0719  ornithine carbamoyltransferase  56.03 
 
 		 308 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435466  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2009  ornithine carbamoyltransferase  55.7 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3106  ornithine carbamoyltransferase  56.68 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0562517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0796  ornithine carbamoyltransferase  56.39 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0926644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2164  ornithine carbamoyltransferase  57.96 
 
 		 331 aa  350  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2039  ornithine carbamoyltransferase  54.93 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0482539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1023  ornithine carbamoyltransferase  56.91 
 
 		 308 aa  346  4e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.459772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1232  ornithine carbamoyltransferase  53.29 
 
 		 311 aa  318  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3140  ornithine carbamoyltransferase  52.29 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47021  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1408  ornithine carbamoyltransferase  52.63 
 
 		 309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.250922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0077  ornithine carbamoyltransferase  45.54 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0046  ornithine carbamoyltransferase  44.95 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.425573  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1358  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  50.16 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 300 aa  295  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 		 305 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 		 305 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  51.58 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  47.52 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  50.17 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  47.85 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 		 304 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  48.36 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 		 306 aa  281  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 309 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 307 aa  281  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46.86 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  47.9 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  46.18 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  49.17 
 
 		 312 aa  280  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 309 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 309 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  45.75 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.32 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  45.93 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  47.37 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  45.78 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 308 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  45.85 
 
 		 306 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  46.91 
 
 		 314 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.23 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  46.64 
 
 		 301 aa  277  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  46.03 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0689  ornithine carbamoyltransferase  46.84 
 
 		 317 aa  276  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 		 560 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  46.38 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  45.1 
 
 		 305 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  45.03 
 
 		 311 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  48.84 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  46.15 
 
 		 307 aa  275  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>