24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4454 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4454  transcriptional regulator, Fis family  100 
 
 
95 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.121305  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3974  Fis family transcriptional regulator  95.79 
 
 
95 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0295  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  102  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0040  hypothetical protein  54.44 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0311  hypothetical protein  53.33 
 
 
93 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.34678  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7032  hypothetical protein  55.56 
 
 
93 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00925543  normal  0.081206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0352  hypothetical protein  49.45 
 
 
93 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2961  hypothetical protein  53.33 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0482  hypothetical protein  52.75 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000043148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1311  hypothetical protein  47.87 
 
 
94 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.328492  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3340  hypothetical protein  51.09 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.652813  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3471  hypothetical protein  51.09 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1854  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703432  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3584  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4190  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4177  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4064  hypothetical protein  48.91 
 
 
98 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2964  Fis family transcriptional regulator  41.38 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0156  hypothetical protein  47.37 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0607  hypothetical protein  48.42 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1002  hypothetical protein  47.13 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0256071 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0655  hypothetical protein  44.94 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236003  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1578  hypothetical protein  45.65 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1498  hypothetical protein  38.24 
 
 
74 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.743357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>