77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4444 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4444  protein of unknown function DUF606  100 
 
 
320 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3965  hypothetical protein  92.19 
 
 
313 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4333  protein of unknown function DUF606  90.94 
 
 
313 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.289222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  81.25 
 
 
315 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3003  hypothetical protein  50.78 
 
 
154 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.856918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  41.94 
 
 
147 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  28.62 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  41.94 
 
 
147 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  41.13 
 
 
147 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  36.17 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  39.86 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  35.42 
 
 
148 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  39.73 
 
 
177 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  36.89 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  36.3 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  38.14 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  24.43 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  34.07 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  36.55 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  37.24 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  35.86 
 
 
148 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  35.46 
 
 
147 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  35.46 
 
 
167 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  37.29 
 
 
170 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  34.31 
 
 
147 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  38.3 
 
 
148 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  35.46 
 
 
147 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  31.71 
 
 
148 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.09 
 
 
174 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  35.77 
 
 
148 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  27.94 
 
 
151 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  35.56 
 
 
148 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  28.46 
 
 
147 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  20.92 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  30.4 
 
 
146 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  31.94 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  32.06 
 
 
147 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  31.25 
 
 
149 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35.83 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  34.78 
 
 
149 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  36.75 
 
 
147 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  31.86 
 
 
146 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  35.48 
 
 
172 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  28.28 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  27.69 
 
 
147 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  32.52 
 
 
151 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  33.87 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  32 
 
 
176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  27.64 
 
 
172 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  33.91 
 
 
172 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 
183 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  37.33 
 
 
145 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  27.64 
 
 
148 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  26.61 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  34.09 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  34.71 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  23.39 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  23.39 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  30.95 
 
 
146 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.28 
 
 
148 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.13 
 
 
146 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  27.78 
 
 
144 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>