26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4431 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4431  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  155  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.619358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  41.56 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  37.5 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  31.58 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  36.99 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1410  hypothetical protein  27.54 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2035  hypothetical protein  32 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  33.8 
 
 
86 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  37.88 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  36 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  31.51 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  32.88 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  32.81 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  26.79 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  30.77 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  32 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  32.31 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  31.94 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  34.48 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  36.67 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>