97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4159 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  100 
 
 		 288 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  71.85 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  51.93 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  45.52 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  47.01 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  45.61 
 
 		 258 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  45.76 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  39.21 
 
 		 258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  39.83 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  39.74 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.83 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.83 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  33.1 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  31.12 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  32.02 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  30.69 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  33.47 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  33.82 
 
 		 278 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  28.2 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  30.99 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  30.94 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  30.61 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  31.54 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.44 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  26.58 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  28.38 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  26.2 
 
 		 271 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  28.28 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  25.42 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  28.7 
 
 		 484 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  25.34 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  28.51 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  27.39 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  24.27 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  26.32 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  27.39 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  26.96 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  26.87 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  23.73 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  27.31 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.71 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  27.69 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  24.32 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  25.99 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  26.47 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  26.14 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  27.78 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  23.26 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  29.51 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  26.25 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  23.61 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  29.58 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  24.6 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  28.67 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  28.67 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  30.65 
 
 		 708 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 669 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  33.08 
 
 		 675 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  27.78 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  32.31 
 
 		 675 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  30.65 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  29.51 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  28.89 
 
 		 773 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  28.14 
 
 		 721 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.03 
 
 		 689 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  24.83 
 
 		 331 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  29.03 
 
 		 712 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  24.53 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 728 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 407 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1563  cytochrome c-like protein  28 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  27.54 
 
 		 721 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  35.82 
 
 		 79 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  27.54 
 
 		 694 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  27.42 
 
 		 691 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.17 
 
 		 726 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  28.23 
 
 		 698 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  25.83 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  30.12 
 
 		 407 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  30.95 
 
 		 181 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  24.82 
 
 		 343 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.33 
 
 		 699 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  25.83 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  35.21 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  27.78 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  25.81 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  26.98 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  26.98 
 
 		 304 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  27.64 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  25.99 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  26.11 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  27.33 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  26.77 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  24.49 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>