More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4111 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.07 
 
 		 486 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 494 aa  981    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  63.71 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  62.65 
 
 		 473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.59 
 
 		 508 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60 
 
 		 509 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  62.38 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  53.55 
 
 		 550 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  57.76 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  58.76 
 
 		 472 aa  475  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  58.31 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  55.33 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  53.08 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  52.04 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  51.66 
 
 		 477 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  52.2 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  51 
 
 		 474 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  51.75 
 
 		 475 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.78 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  51.36 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  49.77 
 
 		 462 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.95 
 
 		 512 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  44.17 
 
 		 537 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  45.04 
 
 		 504 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  44.72 
 
 		 540 aa  319  6e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.88 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  45.14 
 
 		 422 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  43.19 
 
 		 546 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  43.68 
 
 		 538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  41.15 
 
 		 537 aa  306  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.07 
 
 		 537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  44.08 
 
 		 518 aa  273  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  37.53 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.03 
 
 		 568 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  38.73 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  34.35 
 
 		 683 aa  233  8.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  35.94 
 
 		 715 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  34.52 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 581 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  38.67 
 
 		 504 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  35.56 
 
 		 629 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3363  RND family efflux transporter MFP subunit  35.32 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.640634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  34.82 
 
 		 529 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  34.63 
 
 		 377 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  34.13 
 
 		 455 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  32.52 
 
 		 672 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  35.09 
 
 		 509 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 527 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 410 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 545 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_003296  RS05406  putative cation efflux system transmembrane protein  35.2 
 
 		 513 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0474  RND family efflux transporter MFP subunit  34.91 
 
 		 545 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0677608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 		 552 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  33.61 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  31.63 
 
 		 525 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.7 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4014  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  35.11 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2440  secretion protein HlyD  35.47 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2395  secretion protein HlyD  34.94 
 
 		 417 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  hitchhiker  0.00226856 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  33.33 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  34.84 
 
 		 505 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 510 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  36.48 
 
 		 625 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  34.77 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5288  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1647  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0515736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  35.03 
 
 		 513 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.61 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00207274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  30.71 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  35.21 
 
 		 490 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00535  copper/silver efflux system, membrane fusion protein  33.33 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3055  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0592  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.33 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.50273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1626  putative cation efflux system transmembrane protein  32 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.182447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3072  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.33 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0621  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.33 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000664889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0655  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  33.33 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  29.84 
 
 		 489 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4299  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  31.28 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 488 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3423  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  31.02 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0261  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  31.02 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0468  copper/silver efflux system membrane fusion protein CusB  32.79 
 
 		 375 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  33.68 
 
 		 523 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1260  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 497 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  33.07 
 
 		 486 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  31.95 
 
 		 571 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  33.06 
 
 		 490 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.05 
 
 		 497 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  30.96 
 
 		 599 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.66 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1334  secretion protein HlyD  35.81 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>