203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4038 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 96 aa  182  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  93.75 
 
 		 103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  93.75 
 
 		 96 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3938  protein of unknown function YGGT  72.63 
 
 		 95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4464  protein of unknown function YGGT  85.71 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  63.64 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  62.5 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  59.34 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3629  protein of unknown function YGGT  74.74 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  59.55 
 
 		 96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  57.47 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3706  protein of unknown function YGGT  64.38 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.535312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1918  YGGT family protein  61.64 
 
 		 194 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  60.23 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  60.23 
 
 		 96 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  46.32 
 
 		 101 aa  97.1  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1992  YGGT family protein  61.64 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  54.88 
 
 		 97 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4152  hypothetical protein  61.64 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4027  protein of unknown function YGGT  56.16 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.483363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0419  protein of unknown function YGGT  61.76 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  60.29 
 
 		 119 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3372  protein of unknown function YGGT  60.29 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0692  protein of unknown function YGGT  55.88 
 
 		 96 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  46.43 
 
 		 107 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1917  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 102 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.340645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  45.88 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  43.42 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3568  protein of unknown function YGGT  56.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2879  protein of unknown function YGGT  52.05 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  43.9 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1370  protein of unknown function YGGT  56.76 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  37.23 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0341  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0121  YGGT family protein  37.5 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  38.82 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  46.88 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  36.36 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1360  hypothetical protein  33.77 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0028  protein of unknown function YGGT  39.34 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  44.94 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3299  protein of unknown function YGGT  42.67 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3335  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  37.7 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  38.1 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  38.3 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  34.07 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  32.97 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1658  integral membrane protein  34.09 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  34.83 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  39.33 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.18 
 
 		 196 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3094  YGGT family protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  32.05 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  34.07 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  44.3 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4032  protein of unknown function YGGT  31.91 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  34.52 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1212  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  34.07 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  35.37 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3609  protein of unknown function YGGT  32.95 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  40.54 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  36.92 
 
 		 193 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  40.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  40.54 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  40.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  40.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  40.54 
 
 		 213 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  40.54 
 
 		 187 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03580  hypothetical protein  38.2 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  36.9 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  36.9 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0211  protein of unknown function YGGT  34.88 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  36.92 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  31.87 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  33.78 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0011  hypothetical protein  38.64 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>