257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3933 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  95.89 
 
 		 389 aa  724    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 389 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  95.89 
 
 		 389 aa  724    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  78.07 
 
 		 386 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  74.48 
 
 		 388 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  78.1 
 
 		 388 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  40.83 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  44.04 
 
 		 405 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  40.87 
 
 		 389 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  40.37 
 
 		 389 aa  279  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  40.64 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  40.17 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  39.89 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  41.19 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  35.7 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  32.55 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  35.41 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  31.47 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  31.93 
 
 		 393 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  31.49 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  31.49 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  30.51 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  35.16 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  30.17 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  29.97 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  27.27 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  30.52 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  29.02 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  32.35 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  29.97 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  29.09 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  29.18 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  29.18 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  28.85 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.78 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.78 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  28.12 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  28.67 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.38 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  29.14 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  26.81 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  27.34 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.34 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.31 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  31.19 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.5 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  26.86 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  26.88 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.14 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  24.08 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  24.91 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.89 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  23.94 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  26.8 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 370 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.85 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 363 aa  67  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.91 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  28.79 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  26.73 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  23.55 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.89 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  19.4 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  26.77 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>