246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3927 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
384 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  52.92 
 
 
357 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  51.3 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  52.11 
 
 
366 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  50.57 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  53.37 
 
 
366 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  51.83 
 
 
355 aa  336  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  53.45 
 
 
381 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  44.06 
 
 
353 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  44.64 
 
 
353 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.69 
 
 
375 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  45.29 
 
 
348 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  46.96 
 
 
354 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  44.38 
 
 
360 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  41.71 
 
 
353 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  45.43 
 
 
339 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  39.37 
 
 
340 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  29.3 
 
 
365 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 
361 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 
363 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  36.95 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  32.17 
 
 
358 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  31.27 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  34.47 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
355 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
355 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
355 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  32.27 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  32.27 
 
 
335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 
355 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  31.01 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  29.96 
 
 
339 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.32 
 
 
656 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.81 
 
 
658 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.32 
 
 
672 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.49 
 
 
641 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.27 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  32.05 
 
 
724 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.48 
 
 
637 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 
643 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 
464 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
665 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 
651 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
641 aa  67  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
645 aa  66.2  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  31.46 
 
 
447 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.63 
 
 
737 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.73 
 
 
744 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  24.83 
 
 
701 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  22.99 
 
 
284 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
370 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.17 
 
 
678 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
494 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  27.89 
 
 
969 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  26.8 
 
 
670 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  26.15 
 
 
713 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  26.09 
 
 
577 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.43 
 
 
643 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
479 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.81 
 
 
648 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.88 
 
 
758 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 
744 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.7 
 
 
764 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  23.62 
 
 
758 aa  60.1  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  25.63 
 
 
667 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.25 
 
 
761 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.42 
 
 
1081 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
348 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
675 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.26 
 
 
694 aa  58.9  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.45 
 
 
741 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  26.53 
 
 
971 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  28.14 
 
 
487 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.66 
 
 
723 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  25.27 
 
 
725 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  31.29 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
469 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  25.14 
 
 
726 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
421 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  24.34 
 
 
860 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  24.12 
 
 
758 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  28.96 
 
 
450 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 
861 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.62 
 
 
723 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  24.37 
 
 
859 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  26.12 
 
 
447 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  23.7 
 
 
858 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  23.61 
 
 
744 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  24.34 
 
 
701 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.24 
 
 
735 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.89 
 
 
650 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>