214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3885 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  100 
 
 		 271 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  69 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  69 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  54.98 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  49.82 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  50.9 
 
 		 278 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  50.92 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  52.77 
 
 		 271 aa  242  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  49.82 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  49.82 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  55.35 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  50.18 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  47.23 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  46.35 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  45.99 
 
 		 270 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  48.74 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  42.55 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  43.8 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  46.1 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  42.34 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  43.64 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  41.97 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  41.54 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 		 272 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  44.69 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  37.55 
 
 		 272 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  37.68 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  39.64 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  38.77 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  36.52 
 
 		 276 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  33.69 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  36.33 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  35.14 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  35.36 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  32.26 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  35.34 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  36.52 
 
 		 277 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  36.52 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  34.46 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  34.05 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  36.3 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  34.39 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  36.65 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  34.39 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  36.65 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  35.46 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  35.46 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  35.46 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  35.46 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  35.46 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  35.46 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  37.06 
 
 		 281 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  36.93 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  35.59 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  34.52 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  32.28 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  34.38 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  36.49 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  41.44 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  34.36 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  38.12 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  33.69 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.98 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  31.68 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  37.78 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  36.67 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  30.58 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  32.62 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  31.58 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  33.22 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  33.22 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  33.22 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.8 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  42.62 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  33.1 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  33.18 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  37.77 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3366  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  32.03 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  32.75 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  31.34 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  28.52 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  37.26 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  36.7 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  37.29 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  32.53 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  36.57 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  32.95 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  30.35 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>