75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3606 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3606  conserved hypothetical proteinn  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00367306  normal  0.482079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  91.41 
 
 		 228 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  90.91 
 
 		 230 aa  345  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  62.87 
 
 		 203 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5490  hypothetical protein  63.33 
 
 		 204 aa  252  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  63.92 
 
 		 199 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6942  hypothetical protein  58.38 
 
 		 202 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  52.98 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  47.4 
 
 		 178 aa  174  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  54.9 
 
 		 169 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4360  hypothetical protein  52.94 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0487  hypothetical protein  55.56 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  52.8 
 
 		 170 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  52.8 
 
 		 170 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  51.2 
 
 		 179 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  44.72 
 
 		 123 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  42.19 
 
 		 146 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  41.41 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  36.84 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  44.26 
 
 		 147 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  37.75 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  37.58 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  38.73 
 
 		 156 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2595  hypothetical protein  43.55 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.13732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  37.93 
 
 		 145 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  40.83 
 
 		 147 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  36.96 
 
 		 135 aa  92.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  38 
 
 		 145 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  38.76 
 
 		 168 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  37.86 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  34.27 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3114  hypothetical protein  31.65 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  37.23 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  31.91 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  31.88 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.14 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  33.08 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  29.37 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1853  Protein of unknown function DUF2147  36.36 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  28.78 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  34.18 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  33.61 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3442  hypothetical protein  32.35 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  27.2 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6201  Protein of unknown function DUF2147  30.14 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  30.41 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1598  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  31.94 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3722  Protein of unknown function DUF2147  29.13 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861772  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6391  putative signal peptide protein  26.06 
 
 		 145 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  52.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  34.15 
 
 		 161 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  28.12 
 
 		 137 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  27.5 
 
 		 150 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  29.51 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  26.83 
 
 		 262 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  29.46 
 
 		 111 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  27.82 
 
 		 138 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  34.15 
 
 		 161 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2874  putative signal peptide protein  33.56 
 
 		 157 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000419101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  28.1 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  27.81 
 
 		 127 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4317  hypothetical protein  26.97 
 
 		 146 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  45.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03893  putative signal peptide protein  23.84 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0575  Protein of unknown function DUF2147  29.93 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  30.15 
 
 		 129 aa  42  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  25.52 
 
 		 129 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>