64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3604 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  91.11 
 
 		 460 aa  769    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  100 
 
 		 460 aa  893    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  91.11 
 
 		 460 aa  769    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  57.44 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  40.27 
 
 		 445 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  39.64 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  40.56 
 
 		 474 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  40.48 
 
 		 465 aa  260  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  43.64 
 
 		 462 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.64 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  37.92 
 
 		 466 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.92 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  37.67 
 
 		 469 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  37 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  38.06 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  38.05 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  38.05 
 
 		 466 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  38.05 
 
 		 466 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  38.05 
 
 		 466 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  38.05 
 
 		 466 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  38.05 
 
 		 466 aa  216  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 445 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  35.59 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  34.65 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  37.67 
 
 		 471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  36.95 
 
 		 455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  33.98 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  35.18 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  37 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  35.78 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  38.04 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.55 
 
 		 475 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  34.5 
 
 		 471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  33.19 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  33.41 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.52 
 
 		 455 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  36.06 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0280  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.92 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  32.58 
 
 		 454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1751 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 883 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  30.06 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.06 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0311  putative FAD-dependent oxidoreductase protein  32.57 
 
 		 478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  30 
 
 		 499 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 		 523 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7141  hypothetical protein  27.88 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4517  hypothetical protein  26.86 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5992  hypothetical protein  27.45 
 
 		 468 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4369  hypothetical protein  27.27 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3372  hypothetical protein  60.64 
 
 		 239 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  22.92 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  72.92 
 
 		 61 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2487  hypothetical protein  29.61 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00182169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13438  hypothetical protein  24.03 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.729599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  26.84 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  28.48 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  26.11 
 
 		 507 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.98 
 
 		 608 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0276  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>