More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3430 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  100 
 
 
329 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  82.67 
 
 
331 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  83.28 
 
 
331 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  57.76 
 
 
315 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  58.79 
 
 
330 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  56.23 
 
 
312 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  45.48 
 
 
311 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  44.84 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  42.95 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  45.31 
 
 
308 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  43.04 
 
 
308 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  39.63 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  39.41 
 
 
324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  38.04 
 
 
326 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
310 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  36.02 
 
 
311 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  39.15 
 
 
447 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  34.65 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  34.25 
 
 
255 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  35.86 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 
436 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  34.63 
 
 
444 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
456 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  34.62 
 
 
436 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  36.97 
 
 
436 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.95 
 
 
272 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.3 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.3 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  34.98 
 
 
439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  35.54 
 
 
272 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.46 
 
 
577 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  35.12 
 
 
241 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.63 
 
 
274 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  28.46 
 
 
577 aa  105  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  31.54 
 
 
456 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 
358 aa  84  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  29.48 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.09 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
356 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.31 
 
 
260 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  46 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  36.7 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  37.62 
 
 
296 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  41.58 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  44.33 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.25 
 
 
243 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.65 
 
 
213 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  38.94 
 
 
275 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.4 
 
 
257 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
243 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  43.12 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  39.25 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  36.27 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
252 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.39 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  36.43 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  37.17 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
239 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  33.54 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  34.86 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
226 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
247 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  34.26 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
245 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  34.86 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  36.45 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  36.09 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  34.26 
 
 
262 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  35.24 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  36.43 
 
 
251 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30 
 
 
225 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
216 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  32.7 
 
 
291 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
252 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  35.83 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
269 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  35 
 
 
259 aa  56.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
275 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  37.98 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  32.9 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.18 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
257 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 
251 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  33.67 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>