More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3388 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  100 
 
 		 157 aa  323  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  96.82 
 
 		 157 aa  289  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  96.82 
 
 		 157 aa  289  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  90.45 
 
 		 157 aa  277  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  85.35 
 
 		 157 aa  261  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  82.8 
 
 		 157 aa  253  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  69.43 
 
 		 157 aa  231  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  69.23 
 
 		 158 aa  229  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  68.79 
 
 		 157 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 157 aa  227  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  66.24 
 
 		 157 aa  226  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  66.24 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  63.92 
 
 		 158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  62.91 
 
 		 165 aa  209  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 158 aa  203  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  63.76 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  61.64 
 
 		 159 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  56.77 
 
 		 158 aa  200  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  60.26 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  56.77 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  61.01 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  61.64 
 
 		 159 aa  193  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 160 aa  189  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  59.06 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  63.95 
 
 		 152 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  50.65 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  49.37 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  48.05 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  51.61 
 
 		 156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  47.47 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  50 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  49.33 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 148 aa  154  7e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  47.74 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.64 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  51.68 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  47.4 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0277  SsrA-binding protein  50 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0454  SsrA-binding protein  50 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  47.02 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  144  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 148 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  48.32 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  45.65 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  51.06 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  46.62 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  48.7 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.65 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.62 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  45.39 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  46 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  48.3 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  48 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  50 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>