More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3377 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  100 
 
 
115 aa  229  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  87.83 
 
 
115 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  87.83 
 
 
115 aa  207  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  78.22 
 
 
116 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  80.9 
 
 
124 aa  150  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  74.73 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  66.97 
 
 
121 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  71.88 
 
 
121 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  65.14 
 
 
122 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  65.38 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  70.79 
 
 
110 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  68.13 
 
 
324 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  67.78 
 
 
121 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  57.66 
 
 
367 aa  119  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  63.04 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
120 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  55 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
371 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  60.61 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
358 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
360 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
360 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  69.32 
 
 
124 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  50.85 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
221 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
242 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
242 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  68.18 
 
 
124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
230 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
211 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  56.47 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  68.18 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  66.67 
 
 
125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  56.47 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  58.89 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  58.89 
 
 
211 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  65.85 
 
 
125 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  67.05 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
335 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
199 aa  106  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  60.67 
 
 
165 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
157 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
196 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  60 
 
 
198 aa  104  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  60.23 
 
 
342 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  60 
 
 
124 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  59.26 
 
 
206 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  59.26 
 
 
206 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
168 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
179 aa  104  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  65.82 
 
 
169 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  53.33 
 
 
143 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
140 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  64 
 
 
257 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
124 aa  102  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  52.38 
 
 
213 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
243 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6400  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
135 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
367 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  57.14 
 
 
239 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
167 aa  101  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  60.67 
 
 
142 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  45.83 
 
 
150 aa  101  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  63.75 
 
 
238 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
171 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
279 aa  102  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  56.84 
 
 
238 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  58.02 
 
 
261 aa  100  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  57.5 
 
 
202 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  56.18 
 
 
160 aa  100  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  64.56 
 
 
168 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
171 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  56.18 
 
 
160 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
275 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
275 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
124 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  56.25 
 
 
181 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
266 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0451  rare lipoprotein A  80.33 
 
 
64 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  0.956063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  57.5 
 
 
170 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
94 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
166 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
200 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  61.64 
 
 
179 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
203 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
213 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
203 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  65.38 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  50.46 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
114 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
213 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  64.1 
 
 
156 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>