More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3366 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  74.13 
 
 		 433 aa  684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  71.9 
 
 		 438 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  72.79 
 
 		 431 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  71.89 
 
 		 438 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  97 
 
 		 434 aa  873    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  85.25 
 
 		 433 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  73.93 
 
 		 429 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  73.21 
 
 		 434 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  72.79 
 
 		 431 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  71.89 
 
 		 438 aa  660    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  74.59 
 
 		 433 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 434 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 		 427 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  76.8 
 
 		 451 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  72.55 
 
 		 431 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  97 
 
 		 434 aa  873    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  75.99 
 
 		 432 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 		 433 aa  684    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  74.58 
 
 		 432 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  74.82 
 
 		 440 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  90.07 
 
 		 434 aa  815    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 		 433 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  75.52 
 
 		 434 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  72.99 
 
 		 431 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  73.3 
 
 		 431 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  85.25 
 
 		 433 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  74.64 
 
 		 437 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  73.7 
 
 		 439 aa  667    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  74.11 
 
 		 432 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  73.4 
 
 		 431 aa  643    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  86.41 
 
 		 433 aa  764    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 434 aa  893    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  70.28 
 
 		 430 aa  625  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  70.87 
 
 		 439 aa  624  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  71.12 
 
 		 435 aa  619  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  66.51 
 
 		 436 aa  615  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  69.67 
 
 		 432 aa  617  1e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  70.97 
 
 		 434 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 		 432 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  68.16 
 
 		 432 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  67.38 
 
 		 424 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  66.9 
 
 		 424 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  65.8 
 
 		 424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  68.17 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  65.8 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 		 420 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  66.82 
 
 		 438 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  64.85 
 
 		 424 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  65.63 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  65.32 
 
 		 424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  67.78 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 		 424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  68.02 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  64.29 
 
 		 431 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  65.25 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 435 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  63.04 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  61.94 
 
 		 421 aa  528  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.86 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  63.04 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 434 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 431 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  519  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 421 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>