33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3352 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3352  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  263  8e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3156  hypothetical protein  93.28 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3480  hypothetical protein  93.28 
 
 		 145 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5760  hypothetical protein  77.61 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3095  hypothetical protein  64.58 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.137037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  40.15 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  35.53 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  34.93 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  37.41 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  38.19 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18170  predicted protein  34.81 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.579095  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  35.56 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  33.56 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  41.73 
 
 		 263 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  33.8 
 
 		 155 aa  52  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  42.53 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01869  hypothetical protein  33.64 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1800  hypothetical protein  35.97 
 
 		 271 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  27.04 
 
 		 469 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  33.1 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1544  hypothetical protein  33.77 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2581  hypothetical protein  35.14 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  34.51 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0473  hypothetical protein  39.18 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0199581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  37.68 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0749  hypothetical protein  33.75 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.110319  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000574  hypothetical protein  37.08 
 
 		 147 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0529  glutaredoxin  37.6 
 
 		 243 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.566915 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0297  hypothetical protein  38.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>