55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3340 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  98.9 
 
 
182 aa  371  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  99.45 
 
 
182 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  93.96 
 
 
182 aa  357  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  93.41 
 
 
182 aa  357  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  74.18 
 
 
182 aa  284  6e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  2.04771e-07  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  65.5 
 
 
211 aa  228  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  39.77 
 
 
183 aa  126  2e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  39.2 
 
 
178 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  40.12 
 
 
177 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  37.43 
 
 
181 aa  121  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  38.37 
 
 
177 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  39.16 
 
 
181 aa  118  4e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  36.05 
 
 
177 aa  118  4e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  35.75 
 
 
179 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  36.63 
 
 
179 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  36.31 
 
 
181 aa  116  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  37.5 
 
 
179 aa  114  1e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  37.5 
 
 
179 aa  113  1e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  37.5 
 
 
179 aa  114  1e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  34.76 
 
 
165 aa  105  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.57 
 
 
396 aa  96.3  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  31.71 
 
 
160 aa  87  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  29.88 
 
 
178 aa  83.2  2e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 
392 aa  80.5  1e-14  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  29.63 
 
 
393 aa  79  4e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  27.49 
 
 
169 aa  71.2  7e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  27.03 
 
 
174 aa  71.2  8e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  27.49 
 
 
169 aa  70.1  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  25.5 
 
 
190 aa  67.4  1e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  26.35 
 
 
170 aa  67  1e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  23.46 
 
 
393 aa  66.6  2e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  25.75 
 
 
170 aa  65.9  3e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  28.89 
 
 
178 aa  65.9  3e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  1.63018e-10  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  25.75 
 
 
170 aa  65.5  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  30.49 
 
 
167 aa  65.5  4e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.71 
 
 
392 aa  65.5  4e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  25.75 
 
 
170 aa  65.5  4e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  26.35 
 
 
175 aa  63.9  1e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  27.44 
 
 
169 aa  61.2  8e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  26.26 
 
 
178 aa  61.2  8e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  25.86 
 
 
170 aa  60.8  9e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  23.46 
 
 
403 aa  61.2  9e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  25.15 
 
 
191 aa  60.5  1e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  24.71 
 
 
169 aa  60.5  1e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.16 
 
 
393 aa  60.1  2e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  25.61 
 
 
171 aa  59.3  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  25.86 
 
 
169 aa  58.5  5e-08  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  25 
 
 
171 aa  57.8  8e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  27.16 
 
 
393 aa  55.8  3e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  24.68 
 
 
167 aa  51.6  6e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  24.85 
 
 
167 aa  50.1  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  24.85 
 
 
167 aa  49.7  2e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  24.85 
 
 
167 aa  50.1  2e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0614  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  23.33 
 
 
391 aa  42  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>