More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3311 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  83.64 
 
 
448 aa  748    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  100 
 
 
457 aa  930    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  69.72 
 
 
441 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  96.62 
 
 
444 aa  879    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  96.62 
 
 
444 aa  880    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  68.03 
 
 
441 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  68.58 
 
 
445 aa  627  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  71.1 
 
 
461 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  65.24 
 
 
448 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  67.43 
 
 
445 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  66.13 
 
 
443 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  67.51 
 
 
444 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  65.14 
 
 
439 aa  598  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  65.44 
 
 
1121 aa  596  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  63.27 
 
 
448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  62.5 
 
 
448 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.51 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  57.76 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  54.55 
 
 
457 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  56.66 
 
 
441 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.2 
 
 
458 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  55.98 
 
 
445 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  56.76 
 
 
442 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  55.38 
 
 
453 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.76 
 
 
445 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.2 
 
 
458 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.36 
 
 
452 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.4 
 
 
441 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.91 
 
 
457 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.71 
 
 
446 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.83 
 
 
460 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.42 
 
 
450 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  52.62 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.24 
 
 
452 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  53.9 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  52.64 
 
 
452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.76 
 
 
456 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  53.12 
 
 
454 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.56 
 
 
457 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  50.68 
 
 
448 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.64 
 
 
440 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.6 
 
 
449 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.66 
 
 
441 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  50.56 
 
 
455 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  50.45 
 
 
451 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  49.78 
 
 
458 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  49.33 
 
 
448 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  48.55 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  48.28 
 
 
429 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  48.76 
 
 
449 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  51.04 
 
 
447 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  51.11 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  50 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  50.8 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  49.77 
 
 
450 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  46.33 
 
 
440 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.46 
 
 
450 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  49.21 
 
 
450 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.53 
 
 
439 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.44 
 
 
448 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  47.86 
 
 
455 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.14 
 
 
459 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  45.11 
 
 
451 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  48.63 
 
 
474 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  48.31 
 
 
452 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  47.87 
 
 
451 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  50.9 
 
 
451 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.24 
 
 
447 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.5 
 
 
451 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  45.27 
 
 
492 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.17 
 
 
447 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  47.86 
 
 
451 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.44 
 
 
445 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.92 
 
 
442 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  47.76 
 
 
472 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  46.41 
 
 
453 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.7 
 
 
448 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  44.39 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  44.9 
 
 
436 aa  358  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.35 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.47 
 
 
495 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.47 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.47 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  44.34 
 
 
448 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  44.49 
 
 
445 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  46.1 
 
 
443 aa  349  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  44.77 
 
 
469 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  43.9 
 
 
454 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  46.22 
 
 
445 aa  346  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.15 
 
 
441 aa  346  6e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.81 
 
 
453 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  47.7 
 
 
454 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  42.6 
 
 
442 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  44.17 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  45.56 
 
 
467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.81 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  41.69 
 
 
442 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  43.24 
 
 
458 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.26 
 
 
445 aa  332  6e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.91 
 
 
440 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>