More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3167 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  88.01 
 
 		 392 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  100 
 
 		 391 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  87.76 
 
 		 392 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  51.81 
 
 		 382 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  49.87 
 
 		 415 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  42.13 
 
 		 454 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  47.62 
 
 		 414 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.84 
 
 		 455 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.18 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  38.54 
 
 		 457 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.94 
 
 		 455 aa  255  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  39.69 
 
 		 453 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  38.4 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  34.52 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  35.47 
 
 		 442 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  33.87 
 
 		 430 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  34.73 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  33.92 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  34.25 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  34.13 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  31.51 
 
 		 459 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  42.86 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  33.33 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  43.1 
 
 		 290 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  48.2 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.98 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.2 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.15 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  41.81 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  39.02 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  38.63 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  43.04 
 
 		 233 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  43.41 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  43.41 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  37.1 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  39.27 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  37.22 
 
 		 340 aa  133  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  52.24 
 
 		 318 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.14 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  41.9 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.95 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.86 
 
 		 300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.25 
 
 		 305 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  43.41 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  53.45 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  41.85 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  41.67 
 
 		 442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.54 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  38.2 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  47.33 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.67 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.65 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40.25 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  52.59 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.14 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  42.95 
 
 		 305 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.06 
 
 		 238 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45.67 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  36.65 
 
 		 369 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  46.09 
 
 		 538 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.88 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  36.2 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.66 
 
 		 491 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.03 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  44.52 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  51.64 
 
 		 445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  46.72 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  51.79 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  33.47 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  49.58 
 
 		 541 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  41.61 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  47.22 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  43.28 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  44.35 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  38.43 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.87 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  47.15 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  55.65 
 
 		 243 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  45.22 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  46.27 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.22 
 
 		 343 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.06 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.23 
 
 		 238 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  42.54 
 
 		 300 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  40.4 
 
 		 305 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40.4 
 
 		 305 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.75 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.35 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  44.35 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  46.09 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  45.03 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.06 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  52.34 
 
 		 238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  39.13 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  39.77 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.4 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40.94 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  47.97 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  47.97 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>