More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3048 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  49.41 
 
 		 797 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  87.89 
 
 		 776 aa  1377    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  49.68 
 
 		 791 aa  712    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 774 aa  1543    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  66.76 
 
 		 778 aa  992    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  52.39 
 
 		 791 aa  713    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  73.85 
 
 		 769 aa  1098    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  88.16 
 
 		 776 aa  1351    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 692 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 717 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 715 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 688 aa  147  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 709 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 726 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 713 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 700 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 715 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 700 aa  129  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 700 aa  129  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 702 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.86 
 
 		 700 aa  127  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.86 
 
 		 700 aa  127  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 700 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 728 aa  122  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  23.95 
 
 		 721 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 688 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  23.8 
 
 		 706 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.8 
 
 		 706 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  23.65 
 
 		 706 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  23.65 
 
 		 706 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 716 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 718 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 690 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 697 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  25.58 
 
 		 690 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 708 aa  111  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 720 aa  110  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 675 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 702 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 706 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 701 aa  104  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 680 aa  99.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  23.11 
 
 		 712 aa  97.8  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  31.7 
 
 		 727 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  23.67 
 
 		 681 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 736 aa  93.2  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 681 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 706 aa  92  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 742 aa  91.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 678 aa  91.3  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 698 aa  90.5  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  31.92 
 
 		 723 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 705 aa  88.6  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 734 aa  87.4  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 681 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 730 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 703 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 737 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 694 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  23.55 
 
 		 715 aa  81.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.2 
 
 		 726 aa  81.3  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 678 aa  81.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 836 aa  80.5  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 700 aa  78.2  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 700 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.13 
 
 		 682 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  30.3 
 
 		 743 aa  75.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 689 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 701 aa  75.1  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 698 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 733 aa  73.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 740 aa  73.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 666 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  34.68 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  21.63 
 
 		 786 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.28 
 
 		 712 aa  72  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  20.59 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  28.73 
 
 		 710 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 829 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 807 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 697 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  30.63 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4265  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 868 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.585484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  23.59 
 
 		 689 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 736 aa  65.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 714 aa  65.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.96 
 
 		 687 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>