51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3042 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  86.35 
 
 		 632 aa  1011    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  100 
 
 		 634 aa  1214    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  86.67 
 
 		 632 aa  1013    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  41.19 
 
 		 610 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  40.67 
 
 		 611 aa  323  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  39.23 
 
 		 580 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  27.67 
 
 		 656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  28.62 
 
 		 655 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  26.5 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  27.35 
 
 		 654 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  27.05 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  25.34 
 
 		 655 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  26.75 
 
 		 643 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  27.07 
 
 		 648 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  27.36 
 
 		 649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  28.22 
 
 		 654 aa  128  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  24.89 
 
 		 645 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  26.82 
 
 		 603 aa  96.3  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  24.78 
 
 		 649 aa  95.1  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  24.47 
 
 		 645 aa  94.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.26 
 
 		 677 aa  80.5  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.05 
 
 		 626 aa  76.3  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  27.61 
 
 		 660 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  27.55 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1247 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1247 aa  56.6  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  22.42 
 
 		 651 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  22.04 
 
 		 630 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  24.57 
 
 		 608 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  22.92 
 
 		 1013 aa  54.3  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  21.64 
 
 		 709 aa  54.3  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  20.41 
 
 		 617 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.56 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  25.75 
 
 		 791 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  21.58 
 
 		 630 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  27.46 
 
 		 1278 aa  52.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.41 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  20.41 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  20.41 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  20.41 
 
 		 617 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  20.24 
 
 		 617 aa  50.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  20.41 
 
 		 617 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  20.41 
 
 		 617 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  24.47 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.37 
 
 		 675 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  29.55 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  28.83 
 
 		 611 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.15 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  23.35 
 
 		 656 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  28.51 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  19.32 
 
 		 695 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>