More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3022 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 157 aa  307  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  89.17 
 
 		 157 aa  275  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  89.1 
 
 		 157 aa  273  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  75.35 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  74.1 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 158 aa  84.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 161 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  36.44 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  44.59 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  38.95 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2019  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0472428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1775  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1758  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1976  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19608e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3388  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.000000000214754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1940  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1801  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1941  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1806  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0059  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0308587  hitchhiker  0.00000975355 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  28.47 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5185  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  38.18 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.68 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>