69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2984 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
323 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  91.1 
 
 
326 aa  525  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  91.1 
 
 
326 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  73.91 
 
 
322 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  76.72 
 
 
317 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  72.05 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  55.67 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  51.84 
 
 
343 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  46.2 
 
 
314 aa  258  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  45.82 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  42.86 
 
 
337 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  43.49 
 
 
333 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  43.49 
 
 
333 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  42.54 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  42.12 
 
 
347 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  45.61 
 
 
329 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  46.98 
 
 
323 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  41.64 
 
 
339 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  45.3 
 
 
319 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  41.02 
 
 
316 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  43.96 
 
 
328 aa  225  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  45.65 
 
 
327 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  46.01 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  36.81 
 
 
324 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  43.85 
 
 
333 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  35.37 
 
 
327 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  38.29 
 
 
298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  36.44 
 
 
297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  31.85 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  43.82 
 
 
309 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  39.35 
 
 
300 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  36.71 
 
 
297 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  36.55 
 
 
297 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  36.08 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  36.08 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  32.5 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  30.58 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  37 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  30.51 
 
 
308 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0356  hypothetical protein  27.62 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.717668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2987  cell division protein FtsX  26.79 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.238508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5159  hypothetical protein  27.92 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4982  hypothetical protein  27.92 
 
 
341 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5109  hypothetical protein  27.92 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4063  cell division protein FtsX  25.61 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0160  putative cell division permease protein FtsX  29.79 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1553  cell division protein FtsX  24.73 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0406  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00446449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0794  hypothetical protein  25.32 
 
 
299 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.580506  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3672  protein of unknown function DUF214  28.73 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0058  cell division protein FtsX  21.55 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.105068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04920  cell division protein FtsX  26.6 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123508  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1760  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5033  cell division ABC transporter permease FtsX  24.82 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5415  cell division ABC transporter permease protein FtsX  24.82 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0470  cell division protein FtsX  26.6 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5271  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.82 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4863  cell division ABC transporter, permease  24.82 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4878  cell division ABC transporter, permease  24.82 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5301  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.18 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1855  cell division protein FtsX  24.32 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.393875  normal  0.417325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5655  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.54 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4749  hypothetical protein  27.01 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0968947  normal  0.0457706 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0245  cell division protein FtsX  27.05 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0135  protein insertion permease FtsX, putative  25.21 
 
 
300 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5346  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.18 
 
 
297 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5289  cell division ABC transporter, permease protein FtsX  24.18 
 
 
297 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>