107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2898 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  100 
 
 
285 aa  594  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  97.54 
 
 
285 aa  584  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  97.54 
 
 
285 aa  584  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  86.67 
 
 
285 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  70.18 
 
 
295 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  65.49 
 
 
297 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  64.79 
 
 
274 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  64.21 
 
 
275 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  61.62 
 
 
274 aa  357  1e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  56.21 
 
 
287 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  54.23 
 
 
290 aa  305  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  53.17 
 
 
290 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  49.66 
 
 
303 aa  271  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  51.48 
 
 
270 aa  270  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  49.1 
 
 
284 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  48.76 
 
 
316 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  46.3 
 
 
292 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  44.36 
 
 
289 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  41.52 
 
 
286 aa  199  4e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  41.88 
 
 
302 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  42.16 
 
 
301 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  38.21 
 
 
308 aa  162  8e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  34.06 
 
 
321 aa  128  1e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  34.75 
 
 
294 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  35.2 
 
 
290 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.98818e-07 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  30.14 
 
 
326 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  31.71 
 
 
310 aa  120  2e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  33.47 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  36.55 
 
 
293 aa  119  4e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  34.63 
 
 
290 aa  120  4e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  33.2 
 
 
291 aa  119  4e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  30.08 
 
 
284 aa  119  5e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  30.08 
 
 
287 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  33.73 
 
 
301 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  29.67 
 
 
284 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  29.67 
 
 
284 aa  119  8e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  29.63 
 
 
308 aa  118  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  33.08 
 
 
292 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  33.08 
 
 
292 aa  118  1e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  29.67 
 
 
287 aa  118  1e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  33.08 
 
 
292 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  32.27 
 
 
308 aa  117  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  33.08 
 
 
292 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  33.08 
 
 
292 aa  117  2e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  32.79 
 
 
303 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  33.06 
 
 
291 aa  116  4e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  32.54 
 
 
304 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  32.54 
 
 
301 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  33.07 
 
 
293 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  32.54 
 
 
304 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  35.53 
 
 
298 aa  115  8e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  35.53 
 
 
298 aa  115  8e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  35.53 
 
 
314 aa  115  8e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  31.35 
 
 
296 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  33.33 
 
 
421 aa  113  4e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  34.47 
 
 
276 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  26.67 
 
 
324 aa  111  1e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  32.35 
 
 
277 aa  111  1e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  28.78 
 
 
294 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  32.51 
 
 
231 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  4.26374e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  31.55 
 
 
228 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  3.43768e-09 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  29.9 
 
 
224 aa  99.4  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  29.11 
 
 
189 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  31.37 
 
 
189 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  30.05 
 
 
227 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  31.49 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  1.23231e-11 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  31.06 
 
 
298 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  30.05 
 
 
189 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.21736e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  30.39 
 
 
205 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.13334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.03709e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.98472e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.89969e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  29.61 
 
 
302 aa  92.4  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  29.9 
 
 
189 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  30.24 
 
 
189 aa  92  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  29.68 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  30.24 
 
 
189 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  6.60321e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3157  Mn-containing catalase  28.44 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5292  manganese containing catalase  27.71 
 
 
304 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0651334  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  28.57 
 
 
304 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4224  manganese containing catalase  27.7 
 
 
307 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0292992  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  27.23 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  28.57 
 
 
203 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  26.72 
 
 
304 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4594  manganese containing catalase  27.23 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.756991  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  27.92 
 
 
188 aa  85.1  1e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  29.95 
 
 
200 aa  85.1  1e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  29.08 
 
 
190 aa  82.8  6e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  24.71 
 
 
231 aa  81.6  1e-14  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  24.3 
 
 
260 aa  81.6  1e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  29.08 
 
 
190 aa  81.6  1e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  27.92 
 
 
188 aa  82  1e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2783  manganese containing catalase  25.91 
 
 
296 aa  80.5  3e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00681002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  25.69 
 
 
230 aa  79.7  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3115  manganese containing catalase  24.77 
 
 
299 aa  78.6  1e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>