More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2819 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1254  translation initiation factor IF-2  59.86 
 
 		 848 aa  827    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  55.69 
 
 		 883 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3563  translation initiation factor IF-2  59.63 
 
 		 832 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  54.35 
 
 		 885 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0057  translation initiation factor IF-2  64.3 
 
 		 921 aa  909    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  54.13 
 
 		 990 aa  872    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  54.24 
 
 		 959 aa  879    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 885 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  51.14 
 
 		 926 aa  814    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  53.09 
 
 		 896 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  55.77 
 
 		 898 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  68.81 
 
 		 1053 aa  931    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  52.99 
 
 		 965 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3727  translation initiation factor IF-2  86.05 
 
 		 971 aa  1254    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.057525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0440  translation initiation factor IF-2  69.97 
 
 		 883 aa  882    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 894 aa  651    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 922 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0024  translation initiation factor IF-2  67.47 
 
 		 871 aa  880    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0480379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4618  translation initiation factor IF-2  79.86 
 
 		 975 aa  1116    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1165  translation initiation factor IF-2  58.62 
 
 		 836 aa  752    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.58 
 
 		 882 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3816  translation initiation factor IF-2  53.41 
 
 		 856 aa  683    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134229  normal  0.0174936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.18 
 
 		 884 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0293  translation initiation factor IF-2  69.4 
 
 		 1083 aa  925    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00928073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0225  translation initiation factor IF-2  56.09 
 
 		 887 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  55.37 
 
 		 964 aa  885    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2819  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 990 aa  1946    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  56.3 
 
 		 873 aa  765    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0600  translation initiation factor IF-2  69.18 
 
 		 886 aa  870    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2490  translation initiation factor IF-2  52.19 
 
 		 875 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.547741  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2697  translation initiation factor IF-2  93.92 
 
 		 989 aa  1392    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0038  translation initiation factor IF-2  60.16 
 
 		 824 aa  733    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0033  translation initiation factor IF-2  59.65 
 
 		 1045 aa  755    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  54.68 
 
 		 891 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0480  translation initiation factor IF-2  67.06 
 
 		 880 aa  886    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471358  normal  0.3853 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  45.36 
 
 		 907 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0231  translation initiation factor IF-2  68.55 
 
 		 883 aa  873    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0340219  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0031  translation initiation factor IF-2  67.17 
 
 		 868 aa  874    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2611  translation initiation factor IF-2  78.84 
 
 		 981 aa  1106    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.709252  normal  0.107051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2923  translation initiation factor IF-2  93.78 
 
 		 989 aa  1392    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.707465  normal  0.0820286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  65.53 
 
 		 887 aa  841    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2912  translation initiation factor IF-2  60.94 
 
 		 835 aa  762    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.922149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0612  translation initiation factor IF-2  53.56 
 
 		 845 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0968574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  64.03 
 
 		 856 aa  806    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2757  translation initiation factor IF-2  58.17 
 
 		 838 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  63.4 
 
 		 885 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  64.05 
 
 		 917 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2826  translation initiation factor IF-2  58.77 
 
 		 836 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 		 885 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.57 
 
 		 885 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 881 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3043  translation initiation factor IF-2  57.05 
 
 		 861 aa  750    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  54.64 
 
 		 992 aa  636    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2594  translation initiation factor IF-2  60.75 
 
 		 848 aa  738    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.914394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2070  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 		 907 aa  713    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  53.22 
 
 		 949 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 		 889 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  51.86 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  67.58 
 
 		 886 aa  928    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  54.06 
 
 		 880 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 975 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 971 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 975 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.51 
 
 		 894 aa  633  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  51.7 
 
 		 975 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1227  translation initiation factor IF-2  50.35 
 
 		 920 aa  634  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0619631  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 971 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 971 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 971 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  44.78 
 
 		 897 aa  630  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  51.87 
 
 		 889 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 972 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  53.04 
 
 		 868 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1003  translation initiation factor IF-2  53.08 
 
 		 853 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 		 972 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  51.39 
 
 		 976 aa  632  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 968 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 		 989 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0817  translation initiation factor IF-2  54.36 
 
 		 880 aa  631  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792511 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  51.66 
 
 		 969 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.68 
 
 		 896 aa  632  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  54.21 
 
 		 895 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.68 
 
 		 986 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  52.87 
 
 		 868 aa  628  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.85 
 
 		 980 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  47.78 
 
 		 854 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0537  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  51.09 
 
 		 964 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 964 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3360  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.900046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3603  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  54.16 
 
 		 953 aa  625  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3652  translation initiation factor IF-2  55.2 
 
 		 890 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>