42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2808 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  88.14 
 
 		 253 aa  447  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  86.56 
 
 		 253 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  70.9 
 
 		 252 aa  324  7e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  67.5 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  53.51 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  50.89 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  35.06 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  31.17 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  34.02 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  31.15 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  34.84 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  31.11 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  31.09 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  33.65 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.93 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  34.62 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  29.82 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.82 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  26.09 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  31.54 
 
 		 231 aa  49.7  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  40.66 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  21.58 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  30.15 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  28.57 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  29.6 
 
 		 338 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4346  LmbE-like protein  27.22 
 
 		 302 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  26 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  28.57 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  26.41 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  29.2 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  34.44 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  34.15 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  29.2 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  27.6 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2086  LmbE-like protein  28.77 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.197926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  25.62 
 
 		 237 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  26.98 
 
 		 218 aa  42  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>