More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2780 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  100 
 
 		 379 aa  752    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  93.98 
 
 		 382 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  94.24 
 
 		 382 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  70.89 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  72.19 
 
 		 389 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  69.89 
 
 		 386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  52.91 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  50.53 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  52.99 
 
 		 385 aa  358  8e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  50.13 
 
 		 383 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  49.35 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  50.77 
 
 		 389 aa  352  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  49.33 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  48.96 
 
 		 390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  48.69 
 
 		 382 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  53.39 
 
 		 379 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  48.66 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  45.62 
 
 		 398 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  40.16 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.89 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  36.99 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.69 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  39.84 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  39.66 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  38.9 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  41.21 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  43 
 
 		 379 aa  236  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  41.76 
 
 		 362 aa  236  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  39.2 
 
 		 382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  36.96 
 
 		 395 aa  233  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  37.66 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  39.66 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.22 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  36.01 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  37.36 
 
 		 344 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  36.87 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  37.15 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  38.29 
 
 		 382 aa  225  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.97 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  41.85 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  42.09 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  37.01 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  35.4 
 
 		 459 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  35.47 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  39.1 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.83 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  36.39 
 
 		 399 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  38.39 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  37.44 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  33.95 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  36.34 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  35.53 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  37.43 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  33.6 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  38.39 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  38.32 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  35.38 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.13 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  37.61 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  36.2 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  33.43 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  39.86 
 
 		 347 aa  206  7e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  39.59 
 
 		 359 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  35.2 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  33.51 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  32.63 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  37.65 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  36.89 
 
 		 308 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  32.19 
 
 		 462 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  32.19 
 
 		 462 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  28.23 
 
 		 498 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  33.58 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  36.89 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  41.26 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  41.26 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  38.85 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  28.64 
 
 		 503 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  33.6 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  33.6 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  33.6 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  33.6 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  32.18 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  36.1 
 
 		 333 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  33.6 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  33.6 
 
 		 449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  32.55 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  33.33 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  31.3 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  33.33 
 
 		 454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  33.16 
 
 		 389 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  32.46 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  33.85 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  33.51 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  34.46 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  34.46 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  32.7 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  33.24 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  33.99 
 
 		 420 aa  193  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  38.41 
 
 		 309 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.93 
 
 		 464 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>