More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2778 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  100 
 
 		 511 aa  1004    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  78.6 
 
 		 516 aa  749    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  94.72 
 
 		 511 aa  923    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  75.98 
 
 		 500 aa  751    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  95.11 
 
 		 511 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  75.2 
 
 		 501 aa  735    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  62.1 
 
 		 523 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  60.23 
 
 		 522 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  63.77 
 
 		 501 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  61.43 
 
 		 499 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  61.52 
 
 		 498 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  58.08 
 
 		 496 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  62.5 
 
 		 497 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  60.08 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  63 
 
 		 498 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  53.17 
 
 		 520 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  51.8 
 
 		 524 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  51.61 
 
 		 524 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  56.69 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  53.91 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  52.94 
 
 		 528 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  51.87 
 
 		 588 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  51.46 
 
 		 578 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  53.52 
 
 		 502 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  53.37 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  50.2 
 
 		 487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  50.21 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  53.22 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  49.28 
 
 		 535 aa  415  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  51.92 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  50.97 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  50 
 
 		 493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  50.97 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  47.38 
 
 		 515 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  47.66 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  43.65 
 
 		 491 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  46.27 
 
 		 476 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  46.22 
 
 		 508 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  47.06 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.6 
 
 		 483 aa  349  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  43.69 
 
 		 489 aa  349  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.88 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.67 
 
 		 483 aa  345  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  42.95 
 
 		 497 aa  345  8.999999999999999e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  44.2 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  44.2 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  42.43 
 
 		 517 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  43.97 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  44.4 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  43.72 
 
 		 500 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.5 
 
 		 466 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  43.27 
 
 		 520 aa  335  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.63 
 
 		 501 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  45.82 
 
 		 501 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  42.16 
 
 		 520 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  44.81 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  44.81 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  42.41 
 
 		 529 aa  330  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  44.29 
 
 		 496 aa  328  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  42.07 
 
 		 526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.27 
 
 		 518 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  45.23 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  42.51 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  42.94 
 
 		 502 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  40.97 
 
 		 527 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  43.17 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  42.71 
 
 		 524 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  42.83 
 
 		 523 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  39.89 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  42.55 
 
 		 506 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  45.15 
 
 		 496 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.97 
 
 		 458 aa  323  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  43 
 
 		 482 aa  323  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  43.52 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  42.36 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  42.13 
 
 		 527 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  42.09 
 
 		 528 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.26 
 
 		 476 aa  319  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  42.68 
 
 		 464 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  43.68 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  40.17 
 
 		 485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  41.56 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.3 
 
 		 473 aa  312  7.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  42.58 
 
 		 525 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.38 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  47.64 
 
 		 524 aa  309  6.999999999999999e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  43.19 
 
 		 525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40.09 
 
 		 523 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.43 
 
 		 477 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.43 
 
 		 477 aa  306  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.88 
 
 		 474 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.58 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  39.22 
 
 		 505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.16 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.58 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.11 
 
 		 501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.61 
 
 		 479 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.46 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.36 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.73 
 
 		 475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>