33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2686 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 466 aa  946    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  34.29 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  32.97 
 
 		 490 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  33.55 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  28.98 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  25.55 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  24.36 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  29.11 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  27.1 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.11 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  26.56 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  26.56 
 
 		 661 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  26.79 
 
 		 646 aa  70.9  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  24.78 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  26.77 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  25.63 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  25.63 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  24.84 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  24.84 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  24.84 
 
 		 645 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  23.1 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  32.26 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  24.37 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  24.87 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  23.73 
 
 		 624 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  23.73 
 
 		 624 aa  51.2  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  21.93 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  21.93 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  21.93 
 
 		 285 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  23.73 
 
 		 624 aa  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  23.73 
 
 		 624 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0580  major capsid protein HK97  23.22 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0637425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>