54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2499 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  94.74 
 
 		 570 aa  1060    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 570 aa  1130    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  62.43 
 
 		 573 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  61.85 
 
 		 573 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  68.59 
 
 		 582 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  94.56 
 
 		 570 aa  1059    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  46.49 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  48.19 
 
 		 614 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  44.68 
 
 		 628 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  46 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  46.15 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  46.42 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  45.14 
 
 		 584 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  44.7 
 
 		 592 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  47.65 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  44.17 
 
 		 568 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  46.44 
 
 		 569 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  41.55 
 
 		 617 aa  359  7e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  41.55 
 
 		 580 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  41.83 
 
 		 543 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  39.86 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  38.7 
 
 		 518 aa  326  7e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  36.2 
 
 		 569 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  37.95 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  37.38 
 
 		 548 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  38.07 
 
 		 629 aa  284  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  36.38 
 
 		 524 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  33.52 
 
 		 610 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  34.24 
 
 		 597 aa  214  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  31.54 
 
 		 584 aa  187  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  30.06 
 
 		 592 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  29.75 
 
 		 575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  30.15 
 
 		 628 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  31.63 
 
 		 572 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  28.6 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  27.03 
 
 		 581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  30.43 
 
 		 565 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  29.3 
 
 		 567 aa  137  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  29.11 
 
 		 567 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  27.45 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  27.9 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  24.95 
 
 		 557 aa  98.2  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  26.2 
 
 		 547 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  24.68 
 
 		 545 aa  75.5  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  27.06 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  31.14 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  26.82 
 
 		 561 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  26.2 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  27.89 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  33.14 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  30.05 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  17.89 
 
 		 651 aa  52  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  21.81 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  22.77 
 
 		 600 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>