67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2427 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  100 
 
 
250 aa  494  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  87.73 
 
 
246 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  86.82 
 
 
242 aa  347  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  73.02 
 
 
223 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  64.52 
 
 
239 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  53.73 
 
 
285 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  43.87 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.96 
 
 
207 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  38.59 
 
 
225 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  40.25 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  40 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  40 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  41.94 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  34.32 
 
 
212 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  37.28 
 
 
228 aa  106  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  37.74 
 
 
230 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  37.8 
 
 
216 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  36.07 
 
 
204 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  36.14 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  32.65 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  36.02 
 
 
211 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  35.4 
 
 
204 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  35.44 
 
 
186 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  28.37 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  34.78 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  32.22 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  28.93 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  28.93 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  29.17 
 
 
191 aa  67  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  30.38 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  29.21 
 
 
169 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  27.74 
 
 
160 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  30.99 
 
 
197 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  31.21 
 
 
170 aa  62.4  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  26.83 
 
 
180 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  29.65 
 
 
182 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.65 
 
 
182 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  28.05 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  29.56 
 
 
161 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  25.86 
 
 
167 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.43 
 
 
170 aa  55.5  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  26.25 
 
 
174 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.74 
 
 
182 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  27.08 
 
 
184 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  38.2 
 
 
362 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  23.74 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  25.16 
 
 
173 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  33.33 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.19 
 
 
180 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  28.76 
 
 
323 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  31.3 
 
 
198 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.19 
 
 
179 aa  48.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.09 
 
 
202 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  26.8 
 
 
323 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  25 
 
 
144 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.64 
 
 
174 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  27.71 
 
 
179 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.66 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  26.88 
 
 
169 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.37 
 
 
184 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.37 
 
 
184 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.17 
 
 
162 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.37 
 
 
184 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.37 
 
 
184 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.37 
 
 
184 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  27.72 
 
 
166 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 
705 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>