28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2426 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 
253 aa  506  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  90.51 
 
 
252 aa  460  1e-128  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  90.51 
 
 
252 aa  460  1e-128  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  59.38 
 
 
239 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  51.95 
 
 
245 aa  220  2e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  56.02 
 
 
240 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  39.23 
 
 
230 aa  141  1e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  38.42 
 
 
233 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  37.05 
 
 
258 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  35.68 
 
 
256 aa  117  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  34.92 
 
 
243 aa  114  1e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  34.39 
 
 
244 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  33.82 
 
 
250 aa  110  2e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  32.14 
 
 
217 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  32.14 
 
 
255 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  35.42 
 
 
306 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  31.84 
 
 
246 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  32.99 
 
 
221 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  33 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  29.9 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  33.51 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  26.88 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  27.98 
 
 
214 aa  79.3  5e-14  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  32.99 
 
 
235 aa  79.3  6e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  27.6 
 
 
221 aa  77.8  2e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  29.21 
 
 
239 aa  74.7  1e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  28.44 
 
 
206 aa  60.1  3e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  28.23 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>