109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2400 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2400  Deoxyribonuclease V  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0714775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2472  deoxyribonuclease V  92.73 
 
 		 220 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2695  Deoxyribonuclease V  92.73 
 
 		 220 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2816  Endonuclease V  80.91 
 
 		 221 aa  363  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2395  deoxyribonuclease V  81.36 
 
 		 221 aa  362  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28449  normal  0.0577391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3591  deoxyribonuclease V  49.32 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.515588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2924  deoxyribonuclease V  52.05 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0819  endonuclease V  48.87 
 
 		 221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000867821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0217  deoxyribonuclease V  51.17 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.438952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2187  deoxyribonuclease V  54.63 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0045  endonuclease V  51.14 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3179  endonuclease V  50.68 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0602  endonuclease V (deoxyinosine 3'endoduclease)  49.55 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.42515e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1932  deoxyribonuclease V  50 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0543  endonuclease V  48.61 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6148  Deoxyribonuclease V  48.84 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0299  endonuclease V  47.83 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0299  endonuclease V  47.83 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_508  nfi endonuclease V  48.15 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000219342  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1279  deoxyribonuclease V  47.66 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0152491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0569  endonuclease V  46.85 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000150735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4912  endonuclease V  47.64 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.710314 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0258  deoxyribonuclease V  47.91 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0246  Deoxyribonuclease V  50.23 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.520455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0625  Deoxyribonuclease V  48.85 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0954  deoxyribonuclease V  46.61 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0038  Deoxyribonuclease V  48.56 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0932  deoxyribonuclease V  44.91 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000151025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0460  endonuclease V  47.52 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0352  endonuclease V  47.52 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3046  Deoxyribonuclease V  48.08 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3848  endonuclease V  47.52 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3689  endonuclease V  43.81 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46839  normal  0.0492677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1151  endonuclease V  44.54 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2758  deoxyribonuclease V  42.58 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3866  endonuclease V  48.35 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2382  deoxyribonuclease V  41.01 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0771  endonuclease V  42 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.784275  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1173  deoxyribonuclease V  37.61 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0284  Deoxyribonuclease V  42.54 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1562  deoxyribonuclease V  41.74 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2425  endonuclease V  46.54 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2526  endonuclease V  46.01 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13030  endonuclease V  44.75 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03875  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3996  Deoxyribonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4232  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4541  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.905836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4027  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0184754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4446  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000793274 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4489  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.730874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5467  endonuclease V  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3712  endonuclease V  46.88 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03828  hypothetical protein  44.06 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0211  endonuclease V  43.78 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.410173  normal  0.0295932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0220  endonuclease V  44.29 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4060  Deoxyribonuclease V  38.97 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110434  normal  0.145804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0224  endonuclease V  46.7 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0288  endonuclease V  44.44 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.247957  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6470  Deoxyribonuclease V  43.96 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0671268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0871  Deoxyribonuclease V  43.13 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4501  endonuclease V  43.5 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476101 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4499  endonuclease V  43.5 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.105241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4379  endonuclease V  43.5 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.872195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4412  endonuclease V  43.5 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4575  endonuclease V  43.5 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.553382 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0350  deoxyribonuclease V  41.21 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.34523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1400  endonuclease V  43.46 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2231  Deoxyribonuclease V  42.11 
 
 		 223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0289774  hitchhiker  0.00000293854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33580  Endonuclease V  42.01 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  0.688639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3087  Deoxyribonuclease V  36.77 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0954  endonuclease V  42.25 
 
 		 262 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.406571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1073  endonuclease V  41.78 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.646298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0101  Deoxyribonuclease V  35.58 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658544  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3356  Deoxyribonuclease V  40.09 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3033  Deoxyribonuclease V  41.94 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.329103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0899  endonuclease V  42.45 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0261  deoxyribonuclease V  42.16 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3345  deoxyribonuclease V  40.1 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00000497399  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0682  deoxyribonuclease V  41.62 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.718465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3899  Deoxyribonuclease V  45.14 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172074  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3063  deoxyinosine 3'endonuclease (endonuclease V)  32.37 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00139902  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5432  deoxyribonuclease V  40.58 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3125  endonuclease V  37.07 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2984  Deoxyribonuclease V  43.28 
 
 		 250 aa  131  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4157  deoxyribonuclease V  40 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0737618  decreased coverage  0.000116375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1197  Deoxyribonuclease V  40.28 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04762  endonuclease V  43.09 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3777  deoxyribonuclease V  39.88 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1457  Deoxyribonuclease V  41.95 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.162733  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0353  Deoxyribonuclease V  38.92 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3336  Deoxyribonuclease V  32.08 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1668  deoxyribonuclease V  38.46 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  0.261069 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2452  Deoxyribonuclease V  38.97 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1244  deoxyribonuclease V  36.32 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0616034  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2631  Deoxyribonuclease V  40.61 
 
 		 265 aa  114  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1127  Deoxyribonuclease V  39.9 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2338  endonuclease V  38.29 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0237302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3982  Deoxyribonuclease V  33.03 
 
 		 223 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1496  Deoxyribonuclease V  33.33 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>