More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2263 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  90.93 
 
 
485 aa  853    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  91.55 
 
 
485 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  76.13 
 
 
493 aa  695    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  71.05 
 
 
493 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  100 
 
 
485 aa  966    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.63 
 
 
495 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.32 
 
 
476 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.28 
 
 
484 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  47.54 
 
 
496 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.26 
 
 
480 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2039  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.44 
 
 
476 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.02 
 
 
484 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.16 
 
 
485 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  46.09 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  44.01 
 
 
492 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  44.21 
 
 
477 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.51 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.86 
 
 
479 aa  346  6e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.81 
 
 
465 aa  333  6e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.59 
 
 
491 aa  279  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1310  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.9 
 
 
490 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  44.33 
 
 
299 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  35.7 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.19 
 
 
206 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4595  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.4 
 
 
300 aa  203  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3585  putative DNA polymerase related protein  39.92 
 
 
264 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  40.62 
 
 
265 aa  197  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.3 
 
 
213 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.77 
 
 
225 aa  193  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.53 
 
 
217 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  57.87 
 
 
260 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.06 
 
 
220 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.17 
 
 
213 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3335  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.33 
 
 
211 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0920628 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.91 
 
 
213 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  56.73 
 
 
202 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.69 
 
 
209 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.06 
 
 
247 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.166552  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.12 
 
 
224 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2228  hypothetical protein  31.75 
 
 
507 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.69 
 
 
223 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0522  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.28 
 
 
208 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078684 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50 
 
 
219 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4300  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.46 
 
 
207 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.02 
 
 
230 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.02 
 
 
230 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.03 
 
 
223 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.62 
 
 
217 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  49.48 
 
 
218 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.52 
 
 
223 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.98 
 
 
224 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.52 
 
 
223 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  51.52 
 
 
229 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.23 
 
 
217 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.27 
 
 
244 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  49.48 
 
 
218 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  49.48 
 
 
218 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0118  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.69 
 
 
217 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.27 
 
 
207 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4850  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.39 
 
 
279 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0473991  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.59 
 
 
237 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  49.73 
 
 
217 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.12 
 
 
224 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4147  hypothetical protein  39.43 
 
 
295 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.94 
 
 
214 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  53.76 
 
 
229 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  48.91 
 
 
211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  50.58 
 
 
216 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  44.85 
 
 
235 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8784  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.84 
 
 
222 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2853  hypothetical protein  37.75 
 
 
282 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889205  normal  0.120479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3468  hypothetical protein  35.12 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2624  hypothetical protein  35.32 
 
 
279 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.09 
 
 
546 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2364  hypothetical protein  34.92 
 
 
279 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.09488  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  36.55 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2923  hypothetical protein  34.51 
 
 
285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301224  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2769  hypothetical protein  36.14 
 
 
280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230469  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3623  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.86 
 
 
216 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.62 
 
 
210 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.5 
 
 
217 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
206 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1487  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.66 
 
 
245 aa  111  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.23 
 
 
200 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.72 
 
 
186 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.23 
 
 
205 aa  106  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.48 
 
 
193 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.48 
 
 
193 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.06 
 
 
202 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.83 
 
 
281 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.5 
 
 
201 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  38.26 
 
 
210 aa  103  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.38 
 
 
264 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  31.54 
 
 
255 aa  102  1e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.21 
 
 
304 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07281  Uracil-DNA glycosylase  35.98 
 
 
167 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.13 
 
 
205 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.51 
 
 
309 aa  100  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07301  Uracil-DNA glycosylase  34.94 
 
 
167 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4246  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.52 
 
 
323 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>