More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2182 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2500  glycosyl transferase group 1  84.96 
 
 
434 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2182  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
443 aa  867    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347756  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2224  glycosyl transferase group 1  84.49 
 
 
434 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307523  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4355  glycosyl transferase group 1  68.8 
 
 
420 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0471  glycosyl transferase group 1  63.5 
 
 
422 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1719  glycosyl transferase group 1  63.94 
 
 
421 aa  403  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2225  glycosyl transferase group 1  41.81 
 
 
423 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  41.08 
 
 
424 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  41.09 
 
 
424 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4354  glycosyl transferase group 1  41.61 
 
 
421 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1720  glycosyl transferase group 1  38.9 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2590  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3540  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
431 aa  136  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.782852  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3130  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
448 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3402  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  26.24 
 
 
401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6753  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
414 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
415 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
445 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
415 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
392 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
401 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  29.13 
 
 
384 aa  97.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
403 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
394 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
404 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  28.03 
 
 
403 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
403 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
409 aa  86.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
390 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  24.03 
 
 
778 aa  79.3  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  31.34 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
384 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
904 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0922  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
365 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0283  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150207  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
374 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.53 
 
 
536 aa  64.7  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.15 
 
 
354 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  35.76 
 
 
360 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  26.8 
 
 
340 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1918  UDP-glucose:tetrahydrobiopterin glucosyltransferase  33.08 
 
 
359 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  27.32 
 
 
357 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
346 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.61 
 
 
400 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
376 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2498  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.61 
 
 
354 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0521  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.92 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.24 
 
 
354 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2876  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2208  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.31 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5604  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
336 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609172  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2124  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.17 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0628  glycosyltransferase  30.31 
 
 
398 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
372 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0199  glycosyl transferase group 1  37.64 
 
 
346 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31842 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  29.8 
 
 
679 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  37.77 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>