129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2060 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  96.19 
 
 		 210 aa  406  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  95.71 
 
 		 210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  80.95 
 
 		 210 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  57.14 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  56.67 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  55.24 
 
 		 210 aa  248  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  55.5 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  53.81 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  60.48 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  53.1 
 
 		 225 aa  242  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  55.45 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  56.19 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  55.24 
 
 		 210 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  54.76 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  56 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  57.21 
 
 		 214 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  55.25 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  55.25 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  58.33 
 
 		 215 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  52.11 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  54.87 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  54.42 
 
 		 225 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  48.66 
 
 		 223 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  47.87 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  40.66 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  33.02 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3217  putative phage repressor  32.08 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0111001  normal  0.682159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  29.55 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  30.95 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.89 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1193  putative phage repressor  30.77 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0826973  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0789  putative phage repressor  29.8 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233571 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  25.13 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.55 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3983  putative phage repressor  27.68 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000900431  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  24.5 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5832  putative LexA repressor  36.11 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1854  putative phage repressor  37.84 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0873919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  34.72 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  26.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  40.74 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  40.74 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  28.87 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  31.25 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  35.4 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  26.7 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  26.7 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  26.7 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1398  putative phage repressor  29.65 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2020  LexA repressor  40.74 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0633  putative phage repressor  28.84 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  35.23 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6716  LexA repressor  39.51 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7466  LexA repressor  39.51 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0525959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  39.19 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1642  LexA repressor  40.51 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.217888  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  36.49 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1841  LexA repressor  36.17 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.924658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1729  LexA repressor  35.11 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  40 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0145  LexA repressor  40.7 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0813581  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  29.14 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2809  LexA repressor  36.17 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33074  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1791  LexA repressor  38.67 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.117655  hitchhiker  0.00108094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2839  LexA repressor  36.96 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1598  LexA repressor  38.67 
 
 		 239 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1803  LexA repressor  36.59 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00193546  normal  0.136628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  29.55 
 
 		 120 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1320  putative phage repressor  26.46 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.260786 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  29.51 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  29.51 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4496  LexA repressor  36.36 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4371  LexA repressor  40 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  31.19 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  36.28 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  32.58 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  28.76 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2902  putative phage repressor  46.94 
 
 		 107 aa  45.1  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2454  LexA repressor  35.16 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212024  normal  0.397716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2883  LexA repressor  36.36 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  36.11 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3352  putative phage repressor  35.48 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  34.48 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.24 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.46 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1686  putative phage repressor  32.91 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  30.41 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.09 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1353  LexA repressor  38.36 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  21.95 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1892  transcriptional regulator, XRE family  27.67 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1997  LexA repressor  30.95 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0707  LexA repressor  30.95 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.265887 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>