More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2058 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  93.39 
 
 		 358 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 358 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  93.1 
 
 		 358 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  77.25 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  76.54 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  78.06 
 
 		 359 aa  454  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.1 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.94 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  60.63 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.26 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.76 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  58.82 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.7 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.98 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.95 
 
 		 364 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.95 
 
 		 364 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.26 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  55.71 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.57 
 
 		 363 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.7 
 
 		 362 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.31 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  54.52 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.42 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.09 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.44 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 349 aa  310  4e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.15 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 352 aa  301  9e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.14 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  49.01 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.43 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.27 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.18 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.74 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.26 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 362 aa  280  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 354 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  48.58 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 354 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.94 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.82 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.82 
 
 		 347 aa  272  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.52 
 
 		 367 aa  271  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.77 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.01 
 
 		 354 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.94 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.92 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.49 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.92 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 		 364 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.06 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.98 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.71 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.13 
 
 		 335 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.47 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.35 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  43.44 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.67 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.2 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.01 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  42.82 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.71 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.75 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1935  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.02 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.540943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 		 353 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.87 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.38 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  41.04 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.78 
 
 		 377 aa  252  6e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  41.81 
 
 		 336 aa  252  8.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.28 
 
 		 349 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.99 
 
 		 361 aa  251  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  40.38 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  46.42 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  44 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9004  Dihydroorotate oxidase  45.87 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 		 345 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 342 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0179  dihydroorotate dehydrogenase  41.83 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.25 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.58 
 
 		 360 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.11 
 
 		 357 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>